主要症状是肛周持续性剧痛，受压或咳嗽时加重，行走不便，坐卧不安，全身感染症状不显，局部检查：肛旁皮肤有明显红肿，伴硬结和触痛，要去当地正规专业医院进行检查，确认病因后对症下药，按医嘱，进行系统化的治疗。
肛周囊肿开始时先感到肛门部出现一个小硬块，坠胀疼痛，肛门部难受，继则出现红肿，局部皮肤发烫，疼痛加重，全身可出现倦怠不适、食欲不振、坐卧不安、夜寐不宁的体温升高等症状。深部脓肿还会引起会阴部和尾骶部胀痛，出现恶寒发热全身中毒症状。
表皮样囊肿，又称角质囊肿、毛囊漏斗部囊肿，起源于具有分化潜能的上皮细胞，囊壁覆角化上皮。早期多无明显症状，该病一般病程较长，进展较为缓慢，一般无明显疼痛，病变肿物持续逐渐增大。随着肿物逐渐增大，表皮样囊肿可破裂，继发感染或者钙化。
肛周囊肿的症状还是比较明显的，首先局部会出现红肿并伴有发热现象，常为低热，有的时候可出现高热，病者还会有整个身躯倦怠不适，食欲不振，睡眠欠佳等。疼痛是常见的肛周脓肿的早期症状，为逐渐加重的持续不间断性肿痛或跳痛。多数需通过手术治疗。
肛周囊肿的早期症状有周身不适、发热寒战、体温升高等全身中毒症状。局部见肛门一侧肿胀、发红、灼痛、跳痛、压痛、坐卧不安，活动和排便时痛加重，有排尿困难等。低位脓肿出现剧烈肛门疼痛，且这种疼痛持续不减。直肠周围脓肿最主要表现是局部坠胀和便意感，发热常见，最高可超过40°。