肛周囊肿治疗方法有两种，药物治疗或者手术治疗，一般可以清洗用药看情况的，如果是恢复不好的，那么还是要考虑手术的，不然药物等治疗，效果不一定有多好的，所以只能是先保守治疗看恢复的。
常见的肛周囊肿有这三种，骨盆直肠窝脓肿又称骨盆直肠间隙脓肿，较为少见，但很重要。直肠后间隙脓肿属于肛提肌以上深部脓肿，坐骨直肠窝脓肿。治疗措施：少数肛周脓肿用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗，手术有两种方式。
肛周囊肿早期主要表现为局部红肿、疼痛，由于脓肿尚未完全形成，波动感不明显。囊肿初期的治疗方法是进行局部坐浴，促进周围囊肿的吸收，同时使用抗菌消炎类药物治疗。如果囊肿形成，需要及时手术切开引流。
肛周囊肿会出现红肿热痛四大症状，可以局部发热，也可以引起全身的发热，温度最高时可达到39度以上，会感到乏力，小便困难，大便困难，排便不尽感，便意明显。平时多注意喝水。
肛周囊肿的初期表现是会感觉到肛门周围有脓肿，肛门还有坠胀感和大便感，平时要多吃水果蔬菜，注意多喝水，不要吃油腻辛辣刺激性的食物，平时还要多注意锻炼，增强身体素质。
肛周囊肿恢复期会出现难以忍受的疼痛，红肿发热，坠胀不适，坐卧不安，里急后重，大便秘结，排尿不顺畅，也会出现直肠刺激的症状。食欲缺乏、身体打寒战、精神差，全身疲倦乏力等全身中毒的症状表现。