肛裂有两种治疗方式，肛裂扩肛术，肛裂切除术。新鲜肛裂和病程短的可用肛裂扩肛术。陈旧性肛裂和病程长的可用肛裂切除术。首先要明确自己是哪一种肛裂，再决定做哪一种手术。
消毒，毛巾铺设，消毒的直肠低碘载体局部麻醉后，肛门括约肌松弛扩张肛门后，使用止血钳将低端裂缝周围的皮肤约0.5-1厘米，用剪刀在止血钳将皮肤，有结缔组织痔疮，包括在切口，裂缝应该分开的潜在的组织。
肛裂手术前需要清洁灌肠，防止手术后大便。一般骶麻就可以，属于局部麻醉。手术以后是可以正常大便的，无须担心。手术后痛苦不大，可以耐受。保持局部清洁卫生即可，术后忌酒辛辣食物，多食多纤维食物，保持大便通畅。
腰骶麻醉或局部麻醉。术前1日进流质饮食。前排净大便，并剪除肛门周围阴毛。逐渐扩张肛门到4指。自齿状线围绕溃疡做三角形切口，全部切除前哨痔、肥大肛乳头及溃疡。如肛管偏紧，则垂直切除部分内括约肌。
手术办法是在肛管一侧，做一个小切除，内括约肌下缘，断定括约肌间沟后别离内括约肌至齿状线，剪断内括约肌，然后扩展至4指，电灼或压榨止血后缝合切断，可同时切除肥壮肛乳头、前哨痔，肛裂在数周之后自行愈合，该办法治愈率高，但手术不当可导致肛门失禁。
肛裂是指肛管皮肤纵形裂开，并形成感染性溃疡。肛裂微创手术是指注射疗法，主要适应于新鲜肛裂，其治疗目的是解除括约肌痉挛、改善局部血循环，利于创口愈合。注射位置可选择长强穴位封闭、局部及肛门括约肌内，具体的药物选择也较多。