胃肠镜检查时间会根据人体情况来定。
一般情况下，胃镜检查在3至5分钟左右就能结束，一些特殊的情况下，检查时间会增长。在检查操作需要严格的要求退镜时必须慢，经常不会短于6分钟。若是有过腹部手术或生育较多，那么检查时间会更长。
在日常生活中，还需饮食清淡，保证作息规律，适当运动，可以缓解不适，有利于身体恢复。
做肠镜之前需要喝泻药清理肠道，不同药物喝药后排便时间不同，一般2-3小时以后排便，需要多次排便，无法一次性排净的，需要在医院注意观察，有不适症状需要输液治疗，平时生活中在饮食上也要多注意，不要食用过多的辛辣的刺激性食物。
肠镜的管子有1米3和1米6的，在做完肠镜，会有腹胀。是因为在检查的时候给肠腔充气，充气以后，胃肠道蠕动慢，充的气体排出的时间长而引起的胀气。不需要特殊处理，稍等片刻，到厕所做排便的动作，排出肠腔内的气体腹痛消失。
做肠镜检查一般需要10-30分钟，根据医生的熟练程度，和病人的消化道特点不同，结肠镜检查时间也不同，都是有差异的，病人也不用紧张，现在肠镜检查很容易，痛苦少，技术成熟。
用来检查下消化道疾病的常用检查方法，主要由探头、导丝组成，一般导丝长度一米多长，从肛门进入，经过乙状结肠，降结肠，横结肠，升结肠，到达回盲部，然后退出，边退边观察。