它们的主要区别是生长的部位和症状是不一样的。痔疮一般的是生长在直肠管内，一旦发作可以使用相关药膏，进行外塞能够好转。而肛门脓肿一般生长在肛门的周围，可以用手摸到有硬肿块，外用药物没有效果。治疗上，肛门周围脓肿，首先选择脓肿切开引流手术。痔疮应该尽可能给予保守治疗，症状反复发作或者影响生活的3、4期痔疮才考虑手术治疗。
首先考虑还是内痔的可能性比较大。是由于大便干燥，慢性便秘，导致直肠粘膜静脉曲张引起的，肛周脓肿通常表现为使肛门周围的疼痛剧烈的疼痛。有可能是属于痔疮，不用过于担心，当肛周脓肿会有疼痛的感觉。
肛门脓肿属于肛门直肠部位的感染化脓性疾病，而痔疮是肛门直肠部位的静脉团块样肿物，两者属于不同疾病，不存在因果关系，但两者可以同时发病。肛周脓肿建议采用抗炎治疗+手术治疗的方法。痔疮大多经过保守的外用药物治疗可以缓解，严重的才考虑手术治疗。
肛门脓肿常见的症状是肛门部位的红肿疼痛，硬结，发烧或是流脓等症状，是导致肛瘘的常见病因之一的，痔疮是可以分为内痔，外痔，和混合痔的，和痣静脉充血是有很大的关系的。
痔疮和肛周脓肿不同，是常见的肛门直肠疾病。肛周脓肿是一种肛门直肠化脓性感染，痔疮是人体静脉血液回流不畅引起的，这是不同的疾病。痔疮与肛周脓肿的区别在于痔疮发生在肛门边缘，与肛门紧密相连。肛周脓肿是在一定距离处形成的泄漏，可引起局部肿块感染。日常生活中可以摄取维生素c粗纤维食物，保持心态平和，避免过度的忧虑，注意合理饮食和适当的休息，避免吃辛辣刺激的事务，对疾病有好处。
肛门血栓与痔疮的区别在于：痔疮是曲张的静脉，痔静脉淤积、充血导致的。如果淤积时间比较长，会形成血栓，质地比较硬。血栓与痔疮的区别主要在于肛门血栓比较疼痛，而痔疮大多没有症状。