直肠内异物损伤后感染，肛管直肠癌破溃或波及深部的感染，都是肛周脓肿的发病原因。感染性因素，感染是引起肛门脓肿的主要原因。因肛裂、痔疮、肛窦炎、肛门周围皮肤毛囊汗腺炎及肛门周围皮肤病等感染，可形成肛周脓肿。术后因素肛门直肠手术引起感染，而形成的直肠周围脓肿，以及尿道术后感染、会阴部术后感染等引起肛周脓肿。医源性因素，大部分都是治疗方法不当引起的。如内痔手术治疗，因操作不当或感染形成肛周脓肿。
肛周脓肿一般是由于肛窦炎造成的，局部形成脓肿以后保守效果不好。和饮食也有一定的关节，经常吃一些含有刺激性的东西，比如是一些辛辣的东西，久而久之导致炎症问题。
肛周囊肿的症状还是比较明显的，首先局部会出现红肿并伴有发热现象，常为低热，有的时候可出现高热，病者还会有整个身躯倦怠不适，食欲不振，睡眠欠佳等。疼痛是常见的肛周脓肿的早期症状，为逐渐加重的持续不间断性肿痛或跳痛。多数需通过手术治疗。
肛周脓肿是在肛周化脓，出现炎性包块，局部软组织化脓以后会引起病人非常明显的症状，就是非常的疼痛。肛周脓肿主要的发作部位是在肛门周围的间隙，所以病人能摸到局部非常明显的包块，红肿热痛非常明显，经常伴随发烧的情况，低烧在38度左右，高烧病人可以到40度，而且会出现排便不畅，影响排便甚至影响小便，出现小便不畅，所以肛周脓肿一旦发现，一定要及时就诊，而且要及时手术。
肛周囊肿每一个时期的症状都不同。会出现局部症状不明显，但全身症状很明显，自己感觉到肛门里面痛，大便的时候上不出来，出现全身发烧、坐立不安等。局部肛门完全看不出异常，而深部脓肿在肛周脓肿里相对比较危险。