括约肌刺激法：可使用电刺激治疗，通过电刺激随意肌的锻炼，使无力的肌肉恢复功能。抗感染治疗，包括针对需氧菌及厌氧菌的抗生素、中药清热解毒、疏泻通宣，通便、热水坐浴、理疗等。
抗生素治疗，脓肿大且全身症状重者，除根据临床和药敏试验选择有效抗生素外，尚需辅以支持对症治疗。外敷药物，采用中西药物配制消炎止痛软膏，直接涂于裂口处，能减轻疼痛和缓解括约肌痉挛。
近端造口术：目的是为了防止肛门、肛管修复后局部感染，作乙状结肠造口术。抗感染治疗，包括针对需氧菌及厌氧菌的抗生素、中药清热解毒、疏泻通宣，通便、热水坐浴、理疗等。
手术治疗，如肛管损伤严重，若伤口深在，合并括约肌撕裂，可加做近端肠造口，不强求损伤彻底清创和一期修复。抗感染治疗，包括针对需氧菌及厌氧菌的抗生素、中药清热解毒、疏泻通宣，通便、热水坐浴、理疗等。
治疗采用下面的方法较好。清创引流术：肛门伤在局部清创时应尽可能保存组织，对齐后缝合修复，防止畸形愈合。药物治疗：肛管损伤有较大的感染风险，可适当使用抗生素等进行抗感染治疗。