发现得了肛瘘越早检查越好。检查时在肛周皮肤上可见到单个或多个外口，呈红色乳头状隆起，挤压时有脓液或脓血性分泌物排出。外口的数目及与肛门的位置关系对诊断肛瘘很有帮助：外口数目越多，距离肛缘越远，肛瘘越复杂。其他检查应在专业医生操作下进行，包括肛诊、内镜检查、B超检查、磁共振检查等。
肛瘘在有急性炎症感染，存在脓液的时候，是不适合做手术的，因为此时做手术，术后炎症比较重，术后恢复不好。现在既然已经排干净了，那目前是手术时期，手术需要切除瘘管，术后按时的换药消毒，并且应用抗生素预防感染，能够促进术后的恢复，以及预防复发。
脓液排完时可以做手术。肛瘘在有急性炎症感染，存在脓液的时候，是不适合做手术的，术后按时的换药消毒，并且应用相关的药物，能够促进术后的恢复，以及预防复发。在膳食方面需合理调养，适当多食一些高蛋白饮食。
如果是挂线，手术后七天皮筋可以脱掉，局部用稀释的杀菌液坐浴。可以活动或者轻度体力劳动。如果切除创伤较大，考虑应该半个月后可以基本愈合。应为局部经常污染愈合较慢。
肛瘘挂线手术纱布随时可以拿掉的，注意局部清洁，不吃辛辣的食物，多喝水，多吃蔬菜水果香蕉，用棉签消毒伤口，伤口要记得勤换药，避免感染。挂线掉了以后，窦道就不存在了。伤口会慢慢愈合。
如果肛周脓肿得到及时有效的对症治疗。可能不会形成肛瘘的。如果引流不彻底。有可能形成肛瘘。这需要两三个月，具体时间没办法确定的。建议手术治疗后注意调养。按时作息，多喝水，多吃新鲜的水果和蔬菜，忌食辛辣等刺激性食物，保持大便通畅。