肛瘘危害有：肛瘘长期流脓流水，污染内衣，造成病菌滋生，可诱发肛门湿疹、肛门瘙痒等其他肛肠疾病是肛瘘的危害性。另外还有肛门失禁的危害。还会给工作和生活带来很多的不便。
肛瘘的危害包括：肛门周围分泌脓水，脓水污染内裤，易引起皮炎湿疹；肛瘘形成后在肛门周围形成肿块，长时间引起疼痛；由于多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而形成多发性、复杂性肛瘘。
肛瘘的人都有自己切身的体会与痛苦。一旦肛瘘形成，自愈的机会极少，瘘管复杂化后，带来许多麻烦与一定的危害性。首先是脓水污染内裤，剧烈活动后可促使脓液外溢，局部经常受到刺激，皮肤摩擦、瘙痒，非常痛苦，影响工作和学习，久而久之可使身体虚弱消瘦，精神不振，抗病能力下降，出现贫血、发作亦越加频繁，形成互为因果。
按照肛瘘的常规手术原则，即从内口到外口沿瘘管全部切开，将肛瘘开放，那么肛门内外括约肌、肛提肌将大部分被切断，但将会引起不同程度的肛门失禁，平时多注意些，及时上厕所，及时到医院治病。
导致肛瘘的主要原因是解剖学的因素。肛腺在大便的时候起润滑作用，它会分泌一些粘液性的东西，防止大便太干燥。肛腺不发达的人在大便太干燥的时候，容易感染以后形成肛瘘。还有一些体质的因素。包括人过度劳累，这时候就容易抵抗力下降，进而细菌也就容易繁殖起来。喝酒、吃火锅、麻辣食物也会刺激它的产生。