少数肛周囊肿用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗，注意忌酒和辛辣刺激食物，多吃蔬菜水果、多饮水，保持大便通畅，保持肛周清洁干燥，适当运动。
积极锻炼身体，增强体质，增进血液循环，加强局部的抗病能力，预防感染。保持肛门清洁，勤换内裤，便后清洁肛门，对预防感染有积极作用。避免久坐湿地，以免肛门部受凉受湿，引起感染。
应多进食营养价值高、所含必须氨基酸较齐全、配伍比例好的蛋白质，戒烟酒及辛辣食物，不食烟熏、油炸、火烤、腊制腌制菜，自觉改变不良生活方式及不良嗜好。便后要有坐浴的习惯：坐浴是清洁肛门，促进创面愈合和消炎的简便有效的方法。
平时积极锻炼身体，增强体质，能增进和改善肛门部血液循环，使局部的抗病能力提高，能预防感染的发生，一旦发生肛门直肠周围感染，应及早到正规的医院诊治，并采用有效的抗感染措施，包括全身及局部的治疗，可防止炎症蔓延、扩散，切勿轻信游医成所谓“祖传”的宣传而延误诊断及治疗。
肛周囊肿主要是由于肛门周围的皮肤发生感染后而形成的囊肿。在刚开始的时候，症状比较轻的时候可以服用超声速来进行治疗，或者是采用坐浴的方式来减少脓肿。如果囊肿已经有肿液就要采取手术的方式来进行治疗。
发生于肛周的表皮样囊肿存在破裂、继发感染的可能，无论有无临床症状，均建议手术治疗，且强调肿块切除的完整性以降低复发率。表皮样囊肿，又称角质囊肿、毛囊漏斗部囊肿，起源于具有分化潜能的上皮细胞，囊壁覆角化上皮。该病多发于青壮年，是一种良性肿瘤，罕有恶变，多见于面部、颅内、颈部、躯干、阴囊、睾丸等部位，发生于肛周较少见。