中医治疗肛瘘病可以用熏洗疗法，主要用于术前术后的治疗，起到消肿止痛的效果。药物可以用：菊花，黄柏，蒲公英等。主要起到清热解毒，消肿止痛，祛湿止痒的功效。可以先熏蒸，然后再用药水进行外洗。
有效的。主流的治疗方法还是西医的手术，比如挂线法等，这些手术可以将肛瘘部位炎症消除，对于治疗起到根本作用。但是，有些会表现为肛瘘术后不愈合或者出血严重等一系列症状，可以通过中医中药的方式煮水熏洗，可以使肛瘘尽快愈合，对于辅助治疗肛瘘有很大的益处。另外，肛瘘者平时尽量不要吃刺激性食物，像酒类、辣椒、大蒜等辛热之品都不能吃，多吃新鲜水果和蔬菜。
中医治疗肛瘘的优点是痛苦小，中医治疗肛瘘的方法最常用方的是消法，托法，补法。其中消法是先用些消散的药物，使初起的肛周痈疽和炎性外痔等得到消散，免受溃脓和切开之苦。托法是用补益气血的药物，扶助正气，托毒外泄，以免毒邪内陷。补法是用补益的药物，恢复正气，助养患处新生，使疮口、瘘口早日愈合。
中医不太适合。肛瘘的治疗目标是尽可能减少括约肌损伤，消除肛瘘内口和任何相通的上皮化瘘管。可以到正规大医院肛肠科好好咨询一下，如果病情轻，可以采用保守治疗。如果药物效果不好，或者病情继续加重，就需要做手术了，通过手术将瘘管全部切开，必要时将瘘管周围瘢痕组织切除，使伤口自基底向上逐渐愈合。
中医方法较简单，并发症也少，分为切开方法和挂线方法。对于低位肛瘘，采用切开的方法或切除的方法，挂线分为挂实线、挂浮线、挂虚线等。所谓挂线，是在内口和外口之间挂一个丝线或橡皮筋，起到缓慢切割的作用。
首先，肛瘘是一种相对严重的肛肠疾病，它是由肛周脓肿的进一步发展而形成的。对于肛瘘的治疗，西医和中医都需要手术，具体的手术方法取决于病人的程度。如果肛瘘更复杂，瘘管通道更多，治疗也更复杂。