肛瘘常见的病因包括腹泻，上火，免疫力低下，比如本身有糖尿病等。最终导致肛门内部肛窦发炎，引起的肛瘘通常是需要手术治疗，或者内痔注射过深或手术后感染，产后会阴缝合后感染，前列腺、尿道手术后感染等，均可波及肛门直肠引起脓肿及瘘。
肛瘘的形成多见于肛隐窝炎，肛窦炎，反复的炎症感染刺激出现的肛瘘，一旦确诊肛瘘，治疗方案就是进行手术切除，尽量找到内外口，容易恢复高位的需要进行挂线疗法，注意局部的卫生，避免辛辣刺激的食物。
肛瘘是因直肠肛管周围脓肿切开或自行破溃后处理不当而形成的后遗症，肛瘘由内口外口及期间的漏管所组成，外口位于肛周皮肤内口，在肛管或直肠下段。肛瘘可以选择药物和手术的方法相结合来进行治疗。
肛瘘多是非特异性感染的，少数为结核性的。要去当地正规专业医院检查病因后治疗。肛瘘是肛门直肠瘘的简称，是发生在肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流的后遗病变。肛瘘是脓肿后时代，是一个疾病的两个阶段。英文名Analfistula，中医称为肛漏。
肛瘘的形成，往往是由前期的肛周脓肿，最后破溃形成的肛瘘，而肛周脓肿和肛瘘，肛周脓肿处于初期，急性期，一旦破溃了以后，过两三个月，它就会形成一个瘘管，形成肛瘘了，那么肛周脓肿又怎么形成的，一般都是因为抵抗力的下降，抵抗力下降以后，它就会感染，感染以后形成一个脓包，疖子破溃以后，常会有感染源，产生脓再往外流，这样就形成了一个，肛内和肛门外边，相通的一个管道，而形成了肛瘘。
肛瘘是发生在肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流的后遗病变。大多是由于直肠肛管，周围脓肿切开或自行破溃后处置不当而形成的后遗症。肛瘘由内口，外口及其间的瘘管而所组成。外口位于肛周的皮肤，内口可在肛管，直肠下段。肛瘘可以通过手术切除或者是挂线疗法治疗。