艾灸没有固定的时间，什么时候都可以做。饮食过饱、过度劳累、饥饿、醉酒时候、高热、大量吐血、中风闭证及肝阳上亢型头痛时不可艾灸。也就是说在饭前半小时和饭后半小时，避免做艾灸。因为艾灸它非常容易引起血液循环加快，血管扩张，容易引起胃部缺血。这种时候做，容易引起肠胃功能受损。
艾灸是可以每天灸的，长期艾灸可以起到调和气血、疏通经络、放松神经的作用，可以治疗各种疾病；正常情况下艾灸1~2周为一个疗程，在一个疗程结束后，可以隔一天进行艾灸一次，每一次艾灸时间不宜超过半小时；对于身体患有严重的疾病时，可以增加艾灸时间，每天艾灸两次，艾灸时注意不能情绪紧张，艾灸后三小时之内不能洗澡。
一般情况下，艾灸上午做最合适，能够改善相关情况。
上午的时候是最好的艾灸时间，同时从四季上看，夏天是最好的时候，三伏天也是最好的。一般来说，艾灸并没有太多的限制，患者有空闲的时候就可以进行，但一定要坚持艾灸。冬季艾灸后要多加注意保暖，能够防止湿寒趁虚。在夏天，特别是三伏天的时候，在进行艾灸后尽量不要使用冷气，以防受寒，从而影响到治疗效果。
在艾灸后身体的经络和毛孔都是打开的状态，有大量的汗液排出，这个时候洗澡容易着凉感冒。艾灸半小时至一小时以后毛孔收缩不出汗的时候就可以洗澡了，注意水温不宜过凉，多喝水，多吃新鲜蔬菜水果。
在孕早期3个月及孕晚期3个月是不建议同房的。
因为孕早期的胎儿还不稳定，是最容易发生流产的时期，特别是有流产高风险的孕妇。尤其是在孕期的头3个月，一方面胎盘尚未发育成熟，胎盘与子宫壁的连接还不紧密，另一方面孕激素分泌不足，不能给予胚胎强有力的维护，此时进行性生活，可能会造成流产。孕中期是可以同房的。但是建议同房频率不要太高。
艾灸在中午11点到1点，这段时间人体与自然的阳气逐渐转旺，可以达到很好的效果。艾灸的具体时间应该因人而异，夏季大自然阳气最旺的时候，艾灸补益的效果能达到是十分好的状态。