肛周脓肿的明确诊断还是要依靠肛肠病专科医生的对患儿肛门局部的检查，必要时行局部或腔内B超检查以明确病变的范围。如果局部肛周脓肿的没消退反而增大，或局部变软，说明局部已成脓，可以选择切开排脓，引流通畅即可。
肛周脓肿是肛周感染的后期症状，肛周脓肿如果没有得到有效的控制就是肛瘘.如果肛周脓肿的脓包不大，皮肤能代谢下去，一般不会发展成肛瘘.如果肛周脓肿包很大，而且出脓头，破脓了，70％的人结果都是肛瘘.肛瘘只有开刀了。
出现疼痛的时候需要用消炎药及时的消炎治疗炎症才能够缓解疼痛的现象，肛门脓肿是由于炎症感染严重的时候才会出现疼痛的感觉，不要吃辛辣刺激性的食物，避免加重炎症感染的症状，加重疼痛的现象。
主要就是进行局部的消毒处理，应用一些杀菌的药膏进行局部的治疗，重要的就是一定要保证大便的通畅，这样就会避免脓肿有加重的情况的发生，严重时可以选择进行局部的手术治疗的。
肛门脓肿要用抗生素抗炎治疗。要注意肛门卫生，配合抗生素消炎，出现化脓后可到医院引流出脓液。要注意饮食，不能吃辛辣刺激的食物，不能饮酒，平时尽量避免熬夜受凉，尽量避免吃辛辣油腻生冷的东西，不能久坐。