这是一种治疗霉菌或者念珠菌的药物，只用于肠道的霉菌感染，不能应用于其他部位的霉菌感染，比如霉菌性阴道炎。这是由于该药肠道、外用皮肤和黏膜均不吸收，且具有一定肾毒性，要在专业医生指导下使用。
一般情况下，新生儿鹅口疮能用制霉菌素片。
新生儿和6个月以内的婴儿感染白色念珠菌后，会在唇、舌、颊、软腭与硬腭等黏膜处，出现凝乳状的斑点或雪白色的片状假膜。这是家长遵医嘱，将制霉菌素片研碎后、制成混悬液，每2-3小时涂抹黏膜病损处，抑制念珠菌的生长。新生儿患有鹅口疮，家长要注意日常护理，妈妈要避免吃辛辣、刺激的食物。
哺乳期可以使用阴道用药。如果出现了，白带过多，伴有异味和瘙痒的情况，可以去医院做白带常规检查看看，根据检查结果，选择合适的阴道用药治疗，不要随便使用药物，平时要注意阴部卫生，禁食辛辣刺激性的食物。
可以使用2%到5%的碳酸氢钠涂抹口腔，改变酸碱环境，来杀灭病菌，可以在医生指导下，使用制霉菌素涂抹口腔，并且用药要足量、够疗程，才能取得好的效果。注意消毒卫生，避免交叉感染等。
怀孕后可以用治疗妇科炎症，不要盲目使用，只能阴道治疗，不能口服，孕期要注意个人卫生，勤换洗内裤，多用温水烫洗，不要吃辛辣刺激的食物，多吃些水果蔬菜注意休息，不要做体力劳动。
一般情况下，宝宝长期服用制霉菌素有副作用。
制霉菌素主要用于消化道念珠菌肠炎和口腔念珠菌感染，宝宝长期服用制霉菌素的副作用，常见有恶心、呕吐、腹泻等消化道症状，还可能引起过敏性皮疹，长期服用还可能导致宝宝出现低血钾、肾功能损害、肝功能损害等情况。一般不推荐5岁以下的孩子口服制霉菌素。对于有鹅口疮的患儿，使用剂量小、外用，所以可用于新生儿。