巧克力囊肿手术之后，建议如果是腹腔镜手术，建议在一个半月之后同房，如果是开腹手术，需要是两个月再有性生活。由于巧克力囊肿具有复发性，所以术后要继续给予用药治疗。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症，内膜异位到了卵巢，每个月卵巢异位灶反复出血引起囊肿，并且引起盆腔粘连。容易导致输卵管粘连，引起不孕症。手术后一般要休息一个月，在术后一个月内要注意休息，禁止性生活，所以一个月以后可以同房。
巧克力囊肿穿刺抽液术后最少需要休息一个月的时间再同房，一周内适当卧床休息，禁盆浴及阴道冲洗，勤洗勤换内裤，不要劳累，保持外阴的清洁，多补充营养，保持好的情绪。治疗期间也是不要吃太刺激性的食物，不要着凉，注意保暖。
卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢上生长而导致形成，通常会引起进行性的痛经，甚至是导致不孕，当卵巢巧克力囊肿大于五公分以上，而且引起痛经严重的情况，就需要考虑行腹腔镜手术来将卵巢巧克力囊肿切除，一般在切除手术以后，禁止同房和盆浴一个月，以免由于过早的同房和盆浴导致引起盆腔的感染，同时还要禁止做重体力活动，饮食清淡才行。
术后一个月内是不能有性生活的，一个月后如果恢复良好那就可以有适当的性生活及备孕的，然后再注意术后的休息及卫生等建议，术后注意适当活动，避免长时间的卧床，引起术后黏连，并注意观察术后的来经情况，再孕前做下孕前检查和优生检查。
卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢上生长而导致形成，通常会引起进行性的痛经，甚至是导致不孕，当卵巢巧克力囊肿大于五公分以上，而且引起痛经严重，考虑行腹腔镜手术来将卵巢巧克力囊肿切除，一般在切除手术以后，禁止同房和盆浴一个月。