巧克力囊肿20厘米是非常大的，对于巧克力囊肿的病患需尽快进行手术治疗，术后要服用一些药物进行抗炎治疗。如果确定是巧克力囊肿，不进行手术还会继续增大的，可以进行手术治疗，治疗后一个月正常转经后就可以进行备孕的。
巧克力囊肿大就是不正常的，巧克力囊肿分为前期巧克力囊肿和后期巧克力囊肿。前期巧克力囊肿的囊肿直径小于等于3厘米。前期巧克力囊肿症状比较轻微。一般囊肿直径小于等于3厘米，算正常的。
巧克力囊肿一般是子宫内膜异位造成的，巧克力囊肿是子宫内膜移位到卵巢上形成的。癌变的概率非常小，但是可能会影响生育，所以出现巧克力囊肿需要及时去医院做手术，否则巧囊体积会越来越大的。
卵巢巧克力囊肿通常就是由于，子宫内膜异位到卵巢上生长而形成，常见于多次的输卵管通液手术或者是人流手术等原因导致引起，或者是在月经期同房以后导致月经血逆流，而导致引起的子宫内膜异位到卵巢的表现，当卵巢巧克力囊肿小于五公分以下，而且没有引起明显的痛经，这时候就可以不用进行特殊的处理治疗。
复发几率不大。巧克力囊肿术后人的对侧卵巢或同侧卵巢可能有新的病灶，医生又要开始重新用药，甚至有可能要面临再次手术。如果这种病人做过2-3次的手术以后，卵巢体积就会缩小，也就预示着卵巢功能会下降，将来有可能面临早绝经，或者卵巢的抗缪勒氏管激素会下降，卵巢的储备功能下降。
囊肿单纯采取药物进行控制效果是不明显的，及时采取手术治疗，手术可以采取腹腔镜微创手术治疗。囊肿大于5CM就需要手术治疗的，囊肿是会在一定的程度上影响生育和月经的，会降低受孕机会，即使怀孕后也容易引起流产或早产，现在还未结婚未育的情况下，尽早做囊肿剔除术。一般对以后的生育及内分泌没有影响的，只是做囊肿剔除，不需要切除卵巢，所以卵巢的功能是还在的，不影响激素的分泌和调节。
