先天性智能障碍的临床得分为四个等级，70分或更高是正常的。轻微的：50-69，中等的，35-49的。严重的，20-34分。颅内感染、缺氧缺血性脑病、颅内出血、宫内发育不良等都会导致先天性智力低下。智障的治疗要从根本上解决，同时还要进行营养脑细胞的治疗，同时还要进行智力锻炼。轻度和中等智能可以在特殊教育机构中得到一些练习和识字的技能。严重和严重的，可以通过反复练习一些简单的生活动作，让他们有一种规避危险的感觉。
对一些病因较为清楚的疾病，比如先天性代谢缺陷病、先天性甲状腺功能减退症等，应尽早采用饮食疗法或补充甲状腺激素治疗；对症治疗，对智力障碍伴有精神症状的，比如兴奋不安、活动过度、易冲动，可适量使用镇静药或抗精神病药物。
属于先天性脑部发育障碍，不排除有脑瘫的可能。应及时明确诊断。应及时明确具体的病变情况，规律应用营养脑部神经的药物，同时进行有效的康复训练。要注意尽早发现具体病变情况，尽早治疗。
智障儿童的感观灵敏度差，感受外界的能力不足，不能正确地区分颜色、声音，家长可以多带孩子上动物园或外出郊游，不断地讲述在动物园中或野外看到的各种动物的形状、声音、生活习惯，结合图片向孩子讲述，反复的刺激可以加深孩子对外界事物的了解。
智障的孩子主要做康复训练，采取有感觉统合训练，听觉统合训练，蒙台梭利，启智博士，可视音乐治疗仪，可视脑电波治疗仪等手段和先进设备。针对2-8岁孤独症，弱智儿童，运用ABA及结构化等多种训疗手段，采用个别训练和群体训练相结合的方法，对患儿进行运动，感知，认知，语言，生活自理，社会适应等多方面康复训练，良好的生活环境，先进的教学设备，专业化的教师队伍，科学的训练方法，是取得较高康复效果的。
在进行特殊教育的同时，应该针对不同的病因进行治疗，以防止病情发展，有利于康复。可以选用多种氨基酸、脑复康等药物进行治疗。除了少数明确病因的可以早期给予药物治疗外，多数的患儿需要接受教育和训练。