艾滋病后期也就是艾滋病的终末期，这时候免疫力严重下降，出现了机会性感染或机会性肿瘤。机会性感染如肺结核、孢子菌肺炎，主要表现为咳嗽、气喘、胸闷、呼吸困难及呼吸衰竭等。
主要表现为HIV相关症状，各种机会性感染及肿瘤。CD4+T淋巴细胞计数明显降低，HIV血浆病毒载量明显升高。主要表现为持续一个月以上的发热、盗汗、腹泻，体重减轻10%以上。部分的病人表现为神经精神症状，如记忆力减退，精神淡漠，性格改变，头痛，癫痫及痴呆等。
艾滋病晚期可出现各种各样的并发症，患者消瘦，发热，腹泻，结核，肺炎，真菌感染常发，除了各种机会性感染可以在各个系统器官出现，还会出现肿瘤，恶病质，病人抵抗力极差，治疗也复杂困难。
艾滋病到了发病期，患者会出现非常畏惧寒冷，觉得全身都比较乏力，没有精神，持续性的发高烧以及头昏脑胀的症状，关节肌肉也会持续性的出现疼痛，艾滋病的潜伏期通常在半年到一年左右，之后才会发病。
皮疹是艾滋病患者最常见的临床表现，早期会有斑丘疹，可伴有瘙痒，常发生于躯干、面部。发病期间会出现各种各样的皮肤改变，感染性的比如单纯疱疹、带状疱疹、各种真菌感染、念珠菌、股癣、体癣、尖锐湿疣、巨细胞病毒感染，还有口腔黏膜白斑。
