连花清瘟胶囊可以治疗甲流。连花清瘟可清瘟解毒、宣肺泄热，对流行性感冒发热或高热、头痛、咽干咽痛、肌肉酸痛等症有效。
连花清瘟已先后34次被列入国家卫健委、中医药管理局发布的甲型流感、乙型流感、禽流感、新冠肺炎等疾病相关诊疗方案的推荐用药。
研究证实：连花清瘟在降低甲流患者疾病严重程度方面具有显著效果，连花清瘟组可显著缩短甲流患者发热、咳嗽、肌肉酸痛、乏力、头痛等流感症状持续时间，该研究还获得2011年度国家科技进步二等奖。
连花清瘟胶囊对甲流所引起的鼻塞流涕等症状，有较佳的疗效。
当甲型H1N1、H3N2等流感病毒侵犯鼻腔时，病毒所引起的炎症反应，会使鼻黏膜充血水肿、鼻腔内分泌物增多，继而造成鼻腔阻塞，引起鼻塞、流鼻涕的症状。
甲流患者可以服用抗流感的药物治疗，如连花清瘟胶囊。该药物能抑制流感病毒等多种病毒，同时抑制炎症反应，有利于减轻呼吸道黏膜充血水肿、炎性渗出，从而缓解鼻塞流涕等症状。
除了服用药物治疗，患者还可以用热毛巾敷鼻，或采取按摩法，用双指夹鼻按揉双侧迎香穴1～2分钟，以辅助缓解鼻塞的症状。
连花清瘟对甲流引起的发热、头痛等症具有较好的治疗效果，甲流患者是可以服用的。
甲型流行性感冒是一种由甲型流感病毒引起的急性呼吸道传染病，其临床主要表现为发热或高热，伴随明显的头痛、乏力、肌肉酸痛等全身症状，以及咽干咽痛、鼻塞流涕等呼吸道症状。中医称甲型流感为时行感冒，认为其属于“时疫、温病”的范畴，病机为邪热蕴肺，卫气被郁，所以导致患者出现发热、头痛等症状。
连花清瘟胶囊的组方融汇了三朝名医治疗疫证的用药精华，以汉代张仲景《伤寒论》麻杏石甘汤清泻肺热、清代吴鞠通《温病条辨》银翘散疏散外邪、明代吴又可《温疫论》治疫证用大黄经验通腑泄热经验；创新性的加入红景天清肺化瘀，调节免疫，顾护正气，可以较好地祛邪、扶正，改善流感引发的发热、头痛等症状。
不适用于预防甲型流感的药物，这是一种治疗甲型流感病毒的药物。这种药物是神经氨酸酶抑制剂，能控制甲型流感病毒的繁殖，并限制其传播。得了甲型流感，需要隔离治疗，切断传播途径。
儿童甲型流感是由于甲型流感病毒而导致的一个急性的呼吸道传染性疾病。治疗上主要以早期诊断，及时使用抗流感药物，对症治疗为主。及时的隔离患儿并尽可能在发病48小时以内治疗。随时观察病情变化，随时复诊。
连花清瘟胶囊可以治疗甲流。连花清瘟可清瘟解毒、宣肺泄热，对流行性感冒发热或高热、头痛、咽干咽痛、肌肉酸痛等症有效。
连花清瘟用于感冒流感与新冠肺炎防治的安全性和有效性得到国内多家科研院所的研究证实。研究证实，连花清瘟可明显抑制甲型流感病毒(H1N1、H3N2)，禽流感以及乙型流感病毒等多种流感病毒。是国家卫健委《流行性感冒诊疗方案》以及《2023年北京春季流感中医药防治方案试行》中推荐的中成药。