通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
眼底囊肿应该注意休息，保持心情愉悦，注意用眼，特别是手机，电脑，一定要控制，多看远处，绿色的植物。多运动，比如跑步，多吃降火的食物，比如绿豆汤，去正规医院的眼科检查一下。
这段时间饮食需要清淡，不能吃辛辣刺激性的食物，需要多吃新鲜蔬菜和水果，避免干燥。有囊肿肛瘘是需要通过手术来治疗的，用药是没有什么效果的，因为本身已经肛瘘里面都是脓了，必须切开，排出来之后才能完全治好的，所以现在需要去医院检查。
鼻囊肿常见的是鼻前庭囊肿或者鼻窦囊肿的鼻窦囊肿，是上颌窦囊肿。如果是小的囊肿，一般是不需要做什么处理的，定期观察。如果有长大的趋势，就需要考虑手术治疗。如果囊肿比较大，外观也受到影响，影响到鼻子外观或者引起了鼻子面部的症状，就需要通过手术。
卵巢囊肿破裂以后处理方法如下：
对于小的囊肿或单纯浆液性囊腺瘤破裂症状，患者此时可以随诊观察，一般无需特殊治疗，也可以适当应用抗生素预防感染；而对于大囊肿或畸胎瘤破裂的症状，患者常有剧烈腹痛，伴有恶心、呕吐，血压下降等症状，建议患者及时住院，完善相关化验，通过给予补液、抗休克、积极准备手术治疗等方式进行治疗，手术中尽量吸净囊液，并涂片行细胞学检查，明确诊断。
