治疗慢性附睾炎一般可以进行药物治疗、手术治疗。
1.药物治疗：慢性附睾炎主要是由于急性附睾炎没有完全根治，并且经常复发。慢性附睾炎的临床表现比较轻微，检查时会发现附睾部位有硬结，局部有压痛感，附睾不平滑，精索可能会变得更粗，此时可以口服敏感的抗生素，多喝一些水，这样可以有效的缓解病情。
2.手术治疗：但是，如果复发或者是抗感染的药物无效，可以选择手术摘除。
慢性附睾炎应根据细菌培养及药敏试验选择药物。局部热敷或理疗，以促进炎症消退。对于反复发作的慢性附睾炎，可考虑附睾切除或输精管结扎，平时应该吃一些抗菌消炎的食物和吃清热解毒的食物，还有能增强免疫力的食物。
朋友患有慢性附睾炎，主要是由于急性附睾炎治疗不彻底，通常伴有慢性前列腺炎。可口服抗生素和治疗前列腺炎的药物。平时，阴囊应抬高，局部热敷，热水坐浴，理疗等。可以缓解症状。如果症状更明显，局部疼痛更严重，反复发作，影响生活和工作，静脉滴注大剂量抗生素。慢性炎症性附睾炎，指伴有异常肿胀、硬结及其他炎症表现的疼痛或不适。第二类，阻塞性慢性附睾炎，指伴有先天性、获得性或医源性的附睾或输精管梗阻所致的疼痛或不适（如先天性梗阻或输精管结扎术后瘢痕形成）。
选择合适的抗生类药物进行规范，系统的治疗。慢性附睾炎一般是由于身体抵抗力下降，急性附睾炎治疗不彻底等原因引起的。注意休息，避免劳累，避免久坐久立，多喝水，多排尿，不要长时间憋尿。饮食保持清淡营养，不要吃辛辣刺激性的食物。
附睾炎一定要一次性治疗，不然容易遗留后遗症。附睾囊肿以后附睾炎会反复复发严重时得手术切除囊肿，应该先去医院检查睾丸附睾精索静脉彩超确诊，如果是附睾炎就得尽量卧床，静脉滴注抗生素。