引起婴儿入睡摇头晃脑的原因有很多种：
一是头痒，有个风俗是婴儿满月之前没有为婴儿洗发，使头发变得脏乱，若大量流汗，则可使头皮痒得难受，婴儿不表达，只靠摆头减轻痒状；
二是婴儿头湿疹，由于大量流汗或者穿厚厚的衣物，使湿疹发作，还会痒得很厉害，靠头前后磨蹭才能达到搔痒效果；
三是钙、维生素D不足可使婴儿大量流汗，头皮痒得厉害，使婴儿爱往返摩擦。
三个月宝宝睡觉摇头，我们要分析是生理性的还是病理性的。生理性的摇头，一般是在孩子快要入睡的时候出现，完全睡着之后就会消失，这种现象一般在六个月之前的孩子可能会有，这是正常的生理现象。也有一部分孩子睡觉摇头，是由于缺乏维生素D或钙元素造成的，就属于病理性的原因，一般在及时补充维生素D或钙元素后就可逐渐改善。
一般情况下，五个月宝宝睡觉摇头可能是头部湿疹、缺钙等原因导致的。具体内容如下：
1.头部湿疹：如果家长没有注意五个月宝宝的头部清洁卫生护理，可能会导致宝宝长头部湿疹，从而局部瘙痒，出现五个月宝宝睡觉摇头的情况。
2.缺钙：如果五个月宝宝存在缺钙的情况，容易导致出汗增多，睡觉不舒服，为了缓解这种不适感受，可能会出现宝宝睡觉摇头的情况。
一般宝宝在睡觉时摇头，湿疹是比较痒的，所以当枕部湿疹瘙痒时，会通过摇头来解痒，会导致头皮发痒，宝宝摇头来摩擦解痒。二，缺钙，宝宝的生长速度如果过快，没有及时补充维生素D，那么这个时候，就会出现摇头的现象。
如果宝宝平时颜面和躯干某些部位有湿疹存在，这时高度提示家长，一定要注意宝宝是否有耳道湿疹。当耳道湿疹明显时，可以有外耳道的异常分泌物存在，或者家长在宝宝摇头时，试探用棉签或家长的小手指在宝宝耳道的位置轻轻转一转，观察宝宝是否很配合的停下来。如果能够停下来，提示应该是耳朵的问题，这时可以请耳鼻喉科的医生具体诊治一下。
四个月宝宝晚上睡觉摇头要注意以下几种情况：
1.如果室内环境温度过高，或者被子盖得过多，捂得太紧，孩子头枕部出了汗，不舒适，也可能出现睡觉摇头；
2.如果宝宝存在维生素D缺乏佝偻病引，可能会导致神经兴奋性增高，还会影响睡眠，容易睡眠不安，睡觉摇头；
3.孩子出生时有缺氧病史，可能患有缺氧缺血性脑病，神经兴奋性高也容易睡觉摇头。