乙脑减毒活疫苗和乙脑灭活疫苗的区别是在于维持的时间不同。乙脑减毒活疫苗接种次数比较小，一般是只需要接种两次，而且维持的时间也会比较长，而且真空干冻可以长期的保存，乙脑活灭疫苗是一种免疫原性的一种生物制剂，优点是注射以后毒力不能回升，安全性比较好也比较稳定，注射以后维持的时间会比较短，大概只能维持3年到5年左右，需要多次的接种。
乙脑减毒活疫苗一般情况下是免费的。
目前常用乙脑减毒活疫苗，就是用流行性乙型脑炎的减毒株病毒，经过培养后增加保护剂冻干而制成的，属于一类疫苗。由于乙脑是一种能够侵害中枢神经系统的急性传染性疾病，且患病后患儿常常会出现抽搐、颅脑神经瘫痪、共济失调、肢体瘫痪或强直，严重的情况下甚至出现昏迷和死亡。
一般要求8个月以上的健康婴幼儿，以及非流行地区的健康人群，都要注射乙脑疫苗。接种乙脑疫苗，是预防流行性乙型脑炎的有效措施。
乙脑灭活疫苗和减毒疫苗的主要区别在于，乙脑灭活疫苗是死病毒制成的疫苗，不良反应发较少，需要进行多次注射后，才能在宝宝体内形成抗体。多次接种又增加了宝宝的痛苦以及不良反应的发生率。而乙脑减毒疫苗属于活疫苗，存在一定的接种排斥，不良反应相对较明显，但是接种效果好，接种次数少，对宝宝的伤害减少，容易被家长接受。因此，乙脑减毒疫苗要比减毒疫苗好一些。
乙脑减毒活疫苗是国家规定的在计划内的免疫接种疫苗，注射乙脑减毒活疫苗主要作用就是提前预防乙脑病毒感染所导致的脑炎疾病。乙脑减毒活疫苗能够刺激产生抗体，免疫功效非常好，并且保护周期长，一般需要接种两次，前后接种需要间隔一年，防止其不良反应给孩子身体造成负面影响。
乙脑减毒活疫苗事故率并不是很大。乙脑减毒活疫苗是预防乙脑的有效手段，流行性乙脑是由昆虫为媒介传播的，人和牲畜共同患病的疾病，此病起病急，会突然出现高热、惊厥、昏迷，痉挛性瘫痪等中枢神经系统疾病，严重者危及生命。
乙脑灭活疫苗与减毒疫苗有很大的不同之处，就是因为乙脑灭活疫苗是由死病毒制作而成，副作用比较小，要经过多次的注射，才能在婴儿体内产生抗体。
反复的注射会使婴儿的疼痛和副作用的发生率提高。乙脑减毒疫苗是一种活疫苗，有一定的免疫排斥作用，副作用比较大，但是免疫效果好，接种次数少，对孩子的危害小，更容易为父母所接受。所以，乙脑减毒疫苗优于减毒疫苗。
