采用中医进行治疗，效果是比较好的。中医治疗能从根本在于改变囊壁的血液循环和通透性，使囊内液不断被组织吸收，不断减少，并使其不再分泌。这样，随着囊内液压力下降，囊肿体积不断缩小，使囊肿生长不再活跃，从而完全解除囊肿对周围肾脏正常组织的压迫及后顾之忧，使肾功能逐渐恢复，症状彻底缓解。
肾囊肿的治疗具体要看囊肿的大小而定。如果囊肿小于5cm则暂时无特殊治疗方法，但是需要注意饮食与药物对囊肿造成影响。需要忌浓茶、咖啡、巧克力、酒精、非甾体止痛药，这些会促进囊肿增大，同时3-6个月需要复查肾脏超声，观察囊肿是否增大。当囊肿大于5厘米时可以采取囊肿穿刺硬化治疗、囊肿去顶减压术或者肾脏切除术等。
孕妇出现肾囊肿是不太严重的一种病症。但是建议密切观察。
肾囊肿，顾名思义，就是肾实质的一种囊性病变，通常为良性病变，若肾囊肿的体积很小，只要经常复查。若患者出现血尿、蛋白尿等肾功能损害时，就应该到医院就诊。孕妇若出现肾囊肿，无明显症状，可暂时不需要办理，甚至更大，亦可于投产后处理。建议定期进行产前检查，明确胎儿和孕妇的身体状态。
艾灸是不能治疗肾囊肿的，药物也不能治疗肾囊肿，肾囊肿的发病的原因是扩张的肾小管，这段扩张的肾小管，逐步独立，就形成一个囊肿，肾小管的壁有分泌功能，分泌液多就会囊肿增大，分泌液少囊肿增大的不明显。
肾囊肿如果比较大，还是有一定危险性的，囊肿囊壁较薄，较大的囊肿随时都可能在外力撞击时，造成囊肿破裂等，引起出血，因此有一定的危险性，而且囊肿较大时，会影响正常肾功能，引起肾衰竭。