小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
腹泻婴儿可分为两类，即感染性肠炎和消化不良。首先，你需要去医院做常规大便检查。如果大便有炎症，你应该考虑肠炎并使用抗炎药物来控制感染。如果婴儿年龄较小，且反复肠炎，也应考虑乳糖不耐受或肠道过敏的可能性。
腹泻可以导致脱水，电解质紊乱等情况，脑电图，头颅CT检查正常，考虑是剧烈腹泻以后电解质紊乱，低钙血症等引起的抽搐，尽快去专业的医院儿科急诊就诊，检查原因，积极治疗。
肠道内感染，可由病毒、细菌、真菌、寄生虫引起，以前两者多见，尤其是病毒。病毒感染寒冷季节的小儿腹泻80%由病毒感染引起。病毒性肠炎主要病原为轮状病毒，其次有诺如病毒、星状病毒、科萨奇病毒、埃可病毒、冠状病毒等。肠道外感染，有时引起消化功能紊乱，亦可产生腹泻症状，即症状性腹泻。
细菌性的要给予抗生素，同时要缓解腹痛、腹胀、呕吐的并发症状，防止感染加重造成败血症。也可能是脾胃虚弱引起的，建议找一位资深中医用中药调理一下。脾胃虚弱这种病在日常饮食上得需要注意调理，不要吃辛辣刺激性食物，不要吃生冷坚硬寒凉性食物，要多吃些易消化的食物，注意腹部保暖。餐后要适量运动，保持心情愉快。