一旦发现了，确诊是肛瘘，除外了一些手术禁忌证的情况下，还是要采用积极的手术的治疗。手术的治疗，能达到有效治疗的目的。采用比较安全的术式，对于括约肌，对于肛门的功能影响更小的术式。对于低位的肛瘘，可以采用这种切开的手术。
肛瘘的治疗方法主要是通过手术方式，手术的原则是将瘘管彻底的切开或者切除，形成敞开的创面促进它的愈合。它最大的优点是不会造成严重的肛门失禁，同时具有操作简单，出血少，换药痛苦较小的优势。
如果局部症状疼痛不明显，可以暂时保守治疗，生活中密切观察，给孩子多喝水，多吃新鲜的水果和蔬菜，注意局部卫生，保持大便通畅。如果孩子大一些不愈合，可以到正规医院手术治疗。
出现肛瘘的现象，目前要注意护理的，给孩子常清洗一下，再一个多吃长纤维的食物，保持大便不干燥会好一些的。服用点专门的药物都是可以的，不要感染就不要紧的，不行要手术。
得了肛瘘以后，首选的就是手术，唯一的方法也是手术，其他的方法都只是缓解症状，而治疗肛瘘的手术又分很多种，好比肛瘘切开术、肛瘘的剔除术、瘘管剔除术，还有什么补片的填充，免疫制剂的填充等，各种方法很多。
