病人得了肛瘘，可以采用手术治疗，针对不同类型的肛瘘，应采取不同的手术方式来治疗，也可以用痔疮膏来治疗，病人要注意饮食清淡，少食刺激性食物，多喝水，多吃香蕉润肠通便。
微创无痛的肛瘘治疗方法是通过直肠纤维镜进入到肛门里面，通过监视器，直接对内口进行微创电凝，使肛瘘的内口干结闭合，然后洗干净瘘管里面的脓液，这样以后大便后，粪便里面的细菌和粪水进不到四面的组织里面去，就不会形成感染，疼痛。肛瘘一般可以采取挂线或者是手术治疗，需要采取积极的预防，不要有思想负担，多保重粗纤维食物保持大便通畅。积极的预防，提高身体素质。
肛瘘手术后3天局部肿胀属于正常现象，可以饮食清淡避免便秘，忌辛辣刺激食物，注意肛门清洁卫生，注意休息，肛门应用消炎膏，应用消炎药物避免感染，定期医院肛肠外科复查。
肛瘘是肛腺感染化脓引起的，绝大部分都需要手术治疗，不能自愈。因为脓肿虽然破溃或已切开引流，但原发感染源如肛窦炎、或肛腺感染依然存在，肠腔内容物还可从内口继续进入瘘管;肛瘘的治疗可以采用瘘管切开术，肛瘘切除术，或者可以用中医的挂线疗法。
肛瘘手术后十来天伤口出现水肿属于正常现象，因为术后伤口周围应急性的水肿，要多吃些清淡的，有营养的食物。不能吃辛辣生冷或者是比较油腻的食物。适当服用通便润肠药物以保持大便的通畅。