一般情况下，脚指缝里长水泡，若为真菌引起的，则可以使用硝酸益康唑喷雾、复方酮康唑软膏、和盐酸特比萘芬软膏等药物进行治疗。如果已经出现了细菌感染，可以选用抗菌药物进行治疗，如头孢曲松钠、青霉素类。在无真菌的情况下，应考虑有无湿疹的发生，如果是湿疹，应外用卤米松乳膏、糠酸莫米松凝胶，口服氯雷他定分散片、盐酸左西替利嗪片等药物进行治疗。
如果脚上起了很多水泡，可以用注射器抽出里面的渗出液。同时伴有脚气，是由真菌感染引起的。可以用抗真菌的药物治疗，局部使用膏药涂抹都是可以的。脚气具有的传染性，所以还是要做好护理，治疗脚气时，要注意及时、彻底。平时注意个人卫生，穿透气性较好的鞋和袜，保持足部的干燥和清洁。
一般情况下,手缝里起水泡可能是患有疥疮、足癣等疾病的表现,具体内容如下:
疥疮是由于疥螨在皮肤表皮层引起的一种接触传染性皮肤病，若患者与受感染者共用衣物和床上的用品，导致手部体皮肤同疥螨密切接触,就容易造成疥疮感染,进而出现手缝里起水泡的情况。若患者因皮肤癣菌感染患有足癣，用手抓挠脚部后未及时清洗,造成手部传染，也可能导致手缝里起水泡。
脚气起水泡是临床真菌感染的一类型，多伴有瘙痒难忍。治疗上，要避免搔抓，以免局部感染加重病情。如果大于1cm的水疱或者大疱可以局部消毒后抽取疱液，后用抗真菌药膏。
脚趾缝里长水泡奇痒可能是由于感染了真菌以后而造成的局部的炎症性反应，由于该部位出现了真菌感染，从而形成一定的角质层的增生和炎症发生，可能会出现局部的红斑基础上的丘疹，丘疱疹等。
有可能是真菌感染，也有可能是湿疹皮炎。保持局部干燥，不要用手去使劲的抓，或者反复进的摩擦刺激。要保持手部清洁，避免接触刺激性物品，饮食上应以清淡为主，辛辣刺激的食物要少吃。