甲状腺囊肿通常不会自行消失。
甲状腺结节或甲状腺病变，可能与机体碘缺乏病等有关。一般情况下，如果身体无其余不适症状，应定期复查工作，定期随访，囊肿大，影响身体功能，出现呼吸窘迫，应及时进行治疗处理。创造良好的生活习惯休息时间，避免长期疲劳、熬夜等，适当休息。如出现身体异常，及时到医院检查，明确具体情况，避免拖延时间。
甲状腺囊肿病因如下：
1、本病多由肝郁火伏、肝炎增高、情志内伤、肝气郁结引起。其发病机制与经、孕、产、奶等生理功能失调和体质因素等有一定关系，体内阴阳平气、气滞痰凝，堵颈前功能放弃基本病变，久而久之，引起血脉淤血，气、痰、瘀三者相结合本病初有许多果实，久则实至虚，或虚实相杂。
2、由于机体摄入碘减少，导致血甲状腺激素浓度降低，通过神经-体液调节途径垂体前叶分泌大量促甲状腺激素，促使甲状腺肿大。这种肿大实际上是甲状腺代偿性肿大，是甲状腺功能不足的现象。
甲状腺囊肿切除后需要做病理检查的。因为甲状腺囊肿有部分存在恶变的可能性，所以要排除甲状腺癌的可能性。如果是甲状腺癌，需要进一步手术及化疗等治疗。病理检查是为了验证诊断，如果是囊肿可以不用继续治疗，如果不是囊肿而是腺瘤或者恶性肿瘤就需要手术后继续治疗。
甲状腺囊肿是比较常见的甲状腺疾病，主要由碘缺乏引起的甲状腺增生肿大而出现，是退行性病变。
甲状腺囊肿按性质可分为良性和恶性，大部分甲状腺囊肿为良性，但少数甲状腺囊肿也伴有甲状腺癌的出现。甲状腺囊肿是在甲状腺部位生长的囊肿，其中大部分是粘液组织，不是实质性的。根据症状不同，甲状腺囊肿可分为甲状腺滤泡囊肿和甲状腺结节囊肿。甲状腺滤泡囊肿一般与甲状腺本身有炎症性刺激有关，但甲状腺结节囊肿大部分是甲状腺功能下降所致。甲状腺囊肿患者早期无全身性症状，容易漏诊，往往无意识发现颈前肿物，体检偶然发现。但长期不治疗，极少数患者表现为甲状腺功能亢进，部分患者表现为甲状腺功能减退。
早期甲状腺囊肿不是很重，更重要的是致病因对身体的影响还比较小，容易查找和清除。甲状腺囊肿是指在甲状腺中发现含有液体的囊状物。肿块呈圆形，直径多在2～5厘米之间，光滑，一般不疼或轻微疼痛，随着吞咽上下移动。多数是单发结节，少见于多发结节。初期是治疗甲状腺囊肿的好时期，采用科学方法治疗甲状腺囊肿是可以及时治疗的。
甲状腺是人体的重要的内分泌器官，对于新陈代谢的维持调节有着重要的作用。甲状腺可以罹患各种各样的疾病，如果发生甲状腺功能亢进症，应该注意避免海带、紫菜等海产品及加碘盐的摄入。