巧克力囊肿手术后还会痛经，在手术之后还会有痛经的症状，这主要是因为本身的痛经并不是因为卵巢肿大所导致的，或者说痛经除了巧克力囊肿之外还有别的诱发因素，所以会导致做完了巧克力囊肿手术之后依然会痛经。
卵巢巧克力囊肿是指子宫内膜异位症引起的卵巢囊肿，这种疾病本身就对怀孕有一定的影响，手术后反而对怀孕是有帮助的，一般在术后半年内备孕。然后就可以制定自己的生育计划了。
巧克力囊肿的复发几率还是非常高的。在临床上，如果巧克力囊肿的病人术后没有给予相应的干预，绝大多数都会出现复发的情况。主要是因为巧克力囊肿由具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢，才引起的这种囊肿，手术很难把这种活性细胞完全根除掉，所以就会复发。
巧克力囊肿的症状特点为痛经是巧克力囊肿最明显的症状，却是最容易忽略的先兆，常进行性加重。性交疼痛也是一个明显的信号，可能还伴有点状出血，卵巢巧克力囊肿的症状并不是十分的明显。不孕及月经失调，在不孕的女性中，巧克力囊肿造成的不孕占有很高的比例。
卵巢巧克力囊肿，是卵巢的子宫内膜异位囊肿，可以抑制女性排卵，引起痛经。如果不想手术治疗，可以给予药物，采取假孕疗法，就是不来月经，可以抑制生长，但是停药后，会症状会再次出现，囊肿直径如果超过4厘米，进行手术治疗。
巧克力囊肿一般术后不会复发的，配合生活方面注意就可以了。平时一定要注意休息，饮食要清淡，多喝水，多吃青菜和水果，不要吃生冷辛辣的食物，注意腹部的保暖，定期做好复查，有情况要及时去医院处理。