比较小，单一的附睾囊肿是不需要治疗的，如果是比较大的囊肿，或者短时间内增大的囊肿，或者是多发的附睾囊肿可以考虑手术进行切除，一般是手术过程中用蚊式钳分离附睾囊肿，把囊壁完全切除即可。
附睾囊肿是因为性刺激，或感染因素引起的，也可能是精子的管道不通畅引起的。常常表现为睾丸胀痛，坠胀感。患处常常表现为有肿块。如果症状不明显，没有发展的趋势，不需要治疗。
附睾囊肿的治疗方法比较多，如果是轻微不适那可以吃一段时间中药来看看效果。但是如果囊肿大，或者出现了严重的并发症等，那一般建议做手术来治疗会比较好，否则会影响到正常的性生活的。
体征在腹股沟区有压痛，阴囊增大，局部皮肤红肿，如脓肿形成，皮肤呈现干性变薄，易脱落。脓肿亦可自行破溃。如就诊及时，肿大变硬的附睾与睾丸的界限较清，然而几个小时后睾丸与附睾即变成一个硬块，精索因水肿而增粗，几天后出现继发性睾丸鞘膜积液。尿道内可有分泌物。前列腺触诊可发现急性或慢性前列腺炎，在急性期忌做前列腺按摩。
小的附睾囊肿是没有临床症状的，不需要特殊处理。大的附睾囊肿有可能会压迫睾丸，附睾产生压迫的症状，这时候就需要通过手术来进行治疗。另外平时要注意清淡饮食，不要吃辛辣刺激生冷性的食物，不要喝酒。
如果囊肿比较小，也可能会达到自己好，但是如果囊肿比较大就很难达到，还是需要应用药物等进行对症治疗，定期进行复查，看是否有所恢复和好转，如果没有明显的好转，只能是选择进一步进行手术治疗的。避免囊肿逐渐增大，还会引起其他的问题，所以发现要及时去检查，然后治疗，早治疗效果会好，不然出现并发症是痛苦的。
