一般情况下，婴幼儿腹泻时消化功能降低，吸收功能下降，如果婴幼儿是以母乳喂养为主，则可以正常喂养，母亲注意不要吃生冷、辛辣等刺激性的食物；如果是以奶粉喂养为主，则要注意喂奶时遵循少量多次的原则；如果婴幼儿已经添加了辅食，则要注意辅食的清淡、易消化，可以以稀饭、面条等食物为主，减少膳食纤维、蛋白质含量高的食物，避免吃刺激性的食物，并且要注意在婴幼儿腹泻期间不要再添加新的辅食。
抗菌治疗，可使用抗菌药物，静脉点滴或肌肉注射，有效地控制感染；对症支持治疗，比如积极控制高热惊厥、及时进行抗休克治疗、维持水电解质酸碱平衡等。出现肠道菌群失调时，还可以应用益生菌，以利肠道正常菌群恢复。
婴幼儿腹泻的病因有非感染性因素和感染因素两方面，非感染因素主要是饮食不当，包括饮食的量，饮食的结构，饮食的成分和气候条件造成的。感染性因素包括病毒，细菌，真菌，寄生虫。临床上以病毒和细菌最为多见。腹泻严重时要纠正水，电解质紊乱及酸碱失衡，有针对性的给予抗病毒，抗细菌治疗。
治疗的方法有寻找诱因，对症处置的治疗方法，避免过度劳累，勿使腹部受凉，勿食生冷饮食。还有局部灌肠疗法：使较高浓度的药物直接作用于病变部位，以增强杀菌作用，并且刺激肉芽组织新生，一般作保留灌肠。
治疗的方法说是病原治疗的方法，通常需联用两种不同类型的抗菌药物，足剂量、长疗程。对于肠道黏膜病变经久不愈者，可采用保留灌肠疗法。还有一般治疗的方法，卧床休息、消化道隔离，隔离至临床症状消失，大便培养连续两次阴性。给予流质或半流质饮食，忌食生冷、油腻和刺激性食物。
婴幼儿腹泻是目前比较常见的疾病，因婴幼儿抵抗力比较低，很容易受到病毒细菌的感染造成腹泻，如果是有母乳情况下，要优先母乳喂养，人工喂养要吃些容易消化的米粉奶粉等，注意气候变化，喝温水。腹泻会引起肠道有益菌的缺失，需及时补充益生菌。腹泻较严重着还需到医院检验大便、血液，确诊是哪种病毒感染，针对感染情况确定使用药物治疗。