肛门疼痛的处理，需要先确诊诱发肛门疼痛的病因。如果肛门疼痛是肛周脓肿引起的，那么早期的肛周脓肿可以通过静脉使用药物。肛周脓肿成熟了，则需要手术切除治疗，缓解肛门疼痛症状。如果肛门疼痛是由炎性外痔、血栓性外痔引起的，那么需要采用手术切除外痔治疗。
肛门疼痛是患有痔疮的可能，平时养成定时排便的好习惯，保持大便通畅，不要经常久坐久站处于固定一个位置，多吃蔬菜水果和纤维素高的食物，这样可以有效防止痔疮的发展。这种病主要是由于经常性大便干燥，再加上久站久坐不动导致的肛垫下移和肛周静脉丛形成了痔疮。
要先观察大便情况，不能排除是便秘引起了痔疮，如果没有痔疮肛裂，那么肛门疼痛可能与腹部疼痛牵扯到肛门有关系的，产后一直有腹部疼痛可能是子宫恢复不好，有妇科炎症导致的。
生产后出现肛门疼痛是痔疮引起的，很多女性在生孩子的时候会容易出现大便干燥，伤口疼而不敢用力，时间长了就会引起大便干燥，平时要注意不能久坐，不能吃辛辣刺激性的食物，多喝开水，注意个人卫生，保持外阴的清洁干燥。
视情况可以采取手术或者是激光注射等微创治疗方法，一般要注重预防，平时要多注意做适当的提肛运动，保持肛门清洁卫生，两次定时的排便习惯，饮食上也多补充粗纤维食物，多吃点胃肠蠕动，尽量少吃刺激性食物。