三叉神经痛是三叉神经分布区的短暂发作性闪电样疼痛，三叉神经痛确实会引起头痛和牙痛。不同之处在于牙痛的特点是持续跳动，而三叉神经痛是短期和神经样疼痛，长期疼痛无预警发生，并出现突发性、短期和剧烈疼痛。
三叉神经痛会导致牙疼，三叉神经第二支第三支可以支配上下颌牙齿神经，疼痛的扳机点可以在牙齿或牙龈上。
三叉神经痛是指在三叉神经的分布部位发生突然的刺痛，而第二、三支则是控制着上下颚的牙根。一般情况下，疼痛会从触发部位蔓延到全身，触发部位可能在牙齿上，当病人的舌部或无意中碰到时，会产生强烈的刺痛，是正常的现象。
牙痛不会引起三叉神经痛，三叉神经痛可能被误认为牙痛，因为它是三叉神经痛。牙痛和三叉神经痛是两种疾病。牙痛是牙龈发炎或牙根发炎。它的疼痛是一种持续的疼痛，可以通过牙科治疗完全治愈。三叉神经痛不同于牙痛。
病人牙疼有可能是三叉神经痛，主要是由于三叉神经分布在牙齿周围。在患病期间病人会出现面部区域明显的疼痛症状，可以通过使用药物来进行治疗。病人牙疼不能吃辛辣刺激和熏烤腌制的食物，会出现非常大的刺激作用，然后要时刻注意口腔的卫生。
偏头痛不属于三叉神经疼痛，三叉神经疼痛属于三叉神经附近的血管病变或者畸形压迫神经组织引起的疼痛。偏头痛与生活压力、内分泌失调等因素有关。偏头痛与三叉神经痛并无明显关系，临床上要注意鉴别，不可混淆，因为治疗方法不同。偏头痛是由于血管收缩和舒张功能紊乱而引起的血管性头痛。临床表现为单侧或双侧搏动性头痛，疼痛持续5-3天左右，伴有恶心呕吐等症状。非甾体类消炎止痛药物是治疗的主要方法。
在临床上，可以通过临床表现来确诊偏头疼和三叉神经痛。
偏头疼通常是有前兆的，主要症状是视力的减退，或有散射的闪烁的斑纹，这说明偏头疼的症状，在头疼的时候，可以看到额部和大量的一种波动性头疼，有些病人还会影响到另外一边的头疼。三叉神经痛通常是一边电灼样、针刺样、刀割样的疼痛，这种疼痛通常不会超出中间的位置，通常是一边头疼，一边不会出现头疼症状；也有一些人会出现两侧的头疼，这种头疼会在几分钟到一分钟之间。