附睾囊肿是可以通过手术来进行治疗的，当然也可以通过药物来进行治疗，手术的效果是比较比药物治疗效果要好的多。药物治疗的效果是比较慢一些。一定要去医院的男科进行相关检查，明确病情后再进行进一步的治疗。在治疗过程中不能进行性生活。要积极配合。多注意休息。
附睾囊肿，一般是一个良性的肿瘤，一般比较小，单一的附睾囊肿是不需要治疗的，每半年定期复查彩超，如果是比较大的囊肿，或者短时间内增大的囊肿，或者是多发的附睾囊肿可以考虑手术进行切除。
小的附睾囊肿是没有临床症状的，不需要特殊处理。大的附睾囊肿有可能会压迫睾丸，附睾产生压迫的症状，这时候就需要通过手术来进行治疗。另外平时要注意清淡饮食，不要吃辛辣刺激生冷性的食物，不要喝酒。
附睾囊肿无症状者不需治疗，症状较重或囊肿体积较大且已婚有子女者可行手术摘除。手术有可能破坏附睾管而影响生育，故对未婚病人宜慎重。如果确定有附睾炎可以选择输液治疗。
附睾炎和附睾囊肿是两种不同的疾病。附睾炎通常会有明显的红肿热痛的炎症症状。需要选择对细菌敏感的抗菌药物，对症消炎止痛。酌情采用附睾切开减压或附睾切除术。而附睾囊肿没有明显的不适，如果较大的附睾囊肿会有一定的肿胀或者下沉感。无症状不需要治疗，有症状可以选择手术治疗，不然时间久了会影响性功能。
如果附睾有囊肿，平时没有任何不适，没有疼痛，是不需要进行治疗的，如果附睾囊肿想要治疗，只能采取手术的方法进行切除，平时少吃辛辣刺激性的食物，要减少局部的刺激，要注意多休息。