一般来说，患者患有霉菌性阴道炎，在治疗期间来月经了，需要停止使用阴道涂药，不要再吃任何的药，每晚用小苏打水清洗，定期更换护垫，更换内裤，将其放在太阳下曝晒。
来例假时最好不要用药，因为在经期出现了大量的血迹，用药不仅会影响药效，还会引起感染，因此来例假时最好不要用药；女性在月经期间也要避免服用药物。
霉菌性阴道炎治疗期间怀孕，受精卵分裂、胚胎发育的关键时期，这时候使用药物可能会影响胚胎的生长发育，不一定安全。所以，想要保证胎儿发育，必须要定期做孕检，如果孕期各项检查正常，胎儿还是比较安全的。如果检查结果出现异常，需要及时进行治疗。所以怀孕期间不能擅自使用药物，任何药物都不一定安全。如果需要用药的话，一定要在医生的指导下进行用药，这样才能更安全。
通常来说，霉菌性阴道炎治疗期间不会影响月经来潮。
霉菌性阴道炎的治疗绝大部分采用外用药物，在阴道局部进行治疗，所以对内分泌不会造成相应的影响；有一些患者口服药物对月经也不会造成影响。但是如果是患有霉菌性阴道炎，在治疗期间来了月经对治疗会产生一定影响，因为来了月经不可能阴道上药，只能进行口服用药治疗，在月经干净之后可继续在阴道塞药进行治疗。
月经期间犯霉菌性阴道炎可以通过口服杀菌药来进行治疗。
霉菌性阴道炎主要是因为外因感染所导致，多是女性不注重个人卫生，或者在性交时没有做好卫生所导致，所以一般是服用消炎杀菌的药物来进行治疗，比如氟康唑等药物。而且在月经期间女性抵抗力较为虚弱，所以更需要注重私密处的卫生，需要保持外阴处干燥清洁，需要勤换洗内裤。
一般情况下，如果是真菌性阴道炎会对月经造成一定的不良反应。女性经期主要取决于下丘脑垂体的卵巢轴线，而真菌性阴道炎症则是由于受到了假丝酵母菌的影响。其症状以女性外阴瘙痒为主，会有大量的黄豆渣，甚至会有白带、血丝等症状，不过不会对月经造成什么影响，但可能会影响日常的白带情况，如果是霉菌性阴道炎，很可能会复发，建议患者及时去医院就诊，在治疗期间应避免同房，还应做好个人的卫生护理，有利于身体健康。
真菌性阴道炎是一种由假丝酵母菌所致的阴道炎。女性在来月经期间，阴道的免疫力会下降，很有可能导致炎症。念珠菌是一种耐热能力较弱的真菌，当温度达到60摄氏度后，连续1个钟头后，就会导致假丝酵母的致死。但是对于干燥、阳光、紫外线、其他化学物质等有很强的抗性，因此推荐使用高温灭菌。建议患者及时就医，遵医嘱使用必要的抗菌药物进行治疗。