病毒性肠炎的治疗包括要注意休息；注意不要受凉，不要吃生冷食物，注意饮食卫生清洁，可进行腹部热敷，要调节饮食，可以少食多餐。可以服用一些保护胃肠黏膜的药物。严重时要及时到医院治疗。
婴儿患病毒性肠炎，通常由轮状病毒感染引起，需要对症处理。
如果孩子患上了这种疾病的话就会导致身体脱水严重，并且还会对肠道产生一定的刺激和损伤作用。通常小孩都有拉肚子的情况，腹痛和排便不正常，严重时，可并发一系列并发症。在治疗过程中应该根据患儿具体病情进行对症处理，同时还需要对其胃肠功能加以调整。建议先将患儿送医院进行电镜检查，随后可给予患儿口服或静脉补液等措施，以矫正其肠胃酸碱平衡。同时在治疗上也要根据病情进行对症处理，对于一些严重的患儿还要给予必要的抗生素和止痛药。主要是在发病过程中，注意饮食卫生，并做到饮食合理。
小儿轮状病毒感染，多数是因为秋季腹泻导致的主要病原菌，其症状表现为反复腹泻，严重的会有脱水表现。治疗以对症支持为主，加强水和电解质补充，防止脱水，口服药物帮助保护胃肠粘膜，帮助改善消化道微环境，只要没有脱水的情况，会慢慢恢复的。
这种疾病是由病毒感染所致，由于病毒形状呈车轮状，故又称为轮状病毒性肠炎。开始常伴有感冒症状，如发烧、咳嗽、咽红、流鼻涕等，精神萎靡、食欲不振。接着便出现腹泻，每日腹泻5~6次，多则10~20次。大便呈蛋花汤样或水样，带酸臭味，因含胆汁较少，大便颜色较淡。患儿常伴呕吐、腹痛等症状。由于腹泻带来水分和盐分的大量丢失，而引起病儿脱水和酸中毒。
需要使用抗病毒药物进行治疗，也可以选择小儿推拿和药物肚脐贴辅助治疗。喂食方面一定要清淡易消化饮食为主。因为目前临床上对病毒感染性的肠炎病没有特效药物。
小儿腹泻多数有病毒感染引起，少数可以见于细菌感染，病毒感染造成的肠炎一般治疗一周可以逐步康复，少数严重的需要治疗十天，胃肠道功能恢复，各种表现才能逐步好转，要多喂水预防脱水，注意保暖尤其是腹部保暖，进食温热的、容易消化的食物如小米粥等。