一般来说，嘴唇内侧长透明水泡可以通过以下方法治疗。
1、药物治疗：带状疱疹在唇部黏膜形成多个水泡或融合成为大泡时，需要应用泼尼松龙、维生素B族等药物治疗。有疱疹样口疮、手足口病时，可以用聚肌胞、干扰素、阿昔洛韦等药物治疗。
2、直接摘除：唇腺导管发生阻塞，有黏液性囊肿形成时，可在局麻下直接摘除。
一般情况下，下嘴唇内侧起透明水泡可能是疱疹性口炎、天疱疮、唇腺导管阻塞等原因导致的。
1.疱疹性口炎：单纯疱疹病毒感染可能会导致患者出现疱疹性口炎，嘴唇黏膜会出现簇状小水疱，逐渐融合形成大水疱，导致患者下嘴唇内侧起透明水泡。
2.天疱疮：如果患者患有天疱疮，也可能导致下嘴唇内侧起透明水泡。
3.唇腺导管阻塞：如果患者存在唇腺导管阻塞的情况，大量液体集聚在腺体内，形成体积较大的粘液腺囊肿，疱壁较薄，疱液清亮，导致下嘴唇内侧起透明水泡。
正常情况下，口腔内壁有透明的水泡，多见于粘液腺囊肿，而粘液腺囊肿则是一个透明的水泡。这是因为小腺体堵塞引起的液体渗出。也有可能是因为被牙齿咬到了，导致了水泡破裂，水泡就会消失。但是过了一段时间，水泡就会再次出现，反复的出现，需要及时的治疗。若不进行治疗，则会使水泡更坚硬，并会产生角质。
口腔内壁上出现了透明的水泡，可以做外科手术。手术切除后，可以起到很好的治疗效果。
一般情况下，被虫子咬了起透明水泡用伏、糖皮质激素软膏等药，具体内容如下：
被虫子叮咬后会有一个透明的水泡，如果水泡比较小，可以外用碘伏、糖皮质激素软膏等消炎止痒的药物。水泡一般都是在几天内干涸，结痂，再过几天就会恢复如初。如果是被虫子叮咬后，局部有一个大而胀痛的小水泡，可以用无菌注射器进行彻底的清洗，然后用碘伏、夫西地酸、百多邦软膏等进行预防，避免局部接触水，保持干燥。
嘴巴里长了个透明水泡是粘液腺囊肿的症状。
在口腔粘膜下，有数百个细小的唾液腺，这些唾液腺可以排出粘液，主要见于以下唇、软腭和舌尖腹壁。它的排便管道是在口中开放的，因为它的排泄器在损伤后会有大量的液体流出，从而导致了囊的出现。常见的是下嘴唇，通常是有咬嘴唇的人。囊肿在胃粘膜下，为一种半透明的小泡，其表层有正常的粘膜，几天后由于进食等磨擦，会导致囊内的薄膜破碎，但很快就会消失，反复发作后，会形成瘢痕，形成白色的硬块。对未与周边组织粘附的囊肿进行手术治疗；反复或有疤痕的包块应手术治疗；也可以选择使用硬剂注入，或者是冰冻或者是激光。
舌头上出现透明的水泡，很有可能是粘液腺囊肿，这是因为粘液腺腺体导管阻塞，弯曲所致，需要做外科手术来治疗，一般在破溃后会有一丝粘液，但会再次愈合，形成水泡。还有就是舌部出现了水泡，主要是由于病毒性疱疹引起的，可以服用利巴韦林，可以是病毒唑，也可以是在皮肤破溃后涂抹重组人表皮生长因子凝胶或外用溶液等药物。