先天性食管闭锁与基因、炎症、血管发育不完全等有关。
先天性食管闭锁是新生儿消化道的一种常见的发育异常，孕妇在胎儿阶段会有羊水过量，尤其是在妊娠30周以后，会有很多的问题，B超会发现，在B超上，孕妇在食管区会有一个空泡，这就是B超的作用。然而，在胚胎时期，最灵敏、最具专一性的方法就是MRI，不但没有创伤，而且更安全。
孩子食道闭锁可能没有任何症状。
如五型食道闭锁，最可能的症状是咳嗽或肺炎反复发作。一型、二型、三型、四型都可能有反复吐沫、吐泡、呛咳、肺炎的情况打算。有些孩子会在喂奶后有吐奶的情况，这些都是一种症状表现。一旦发现孩子有这些情况，要及时明确，防止病情延误，一些孩子可能会有感染加重甚至危及生命的情况发生。
胎儿食道闭锁超声检查的解释如下：
产前胎儿羊水过多是导致食道闭锁胎儿早产的重要因素，因此当羊水过多时需要及时治疗。选择在有新生儿抢救的医疗中心分娩。由于食道闭锁的胎儿出生时常有羊水吸入，所以尽可能在分娩时作好围产期的处理和呼吸道出生时的护理，减少或避免出现新生儿肺炎或羊水吸入综合征的发生。目前比较典型的超生的特征，主要就是一个胃泡的变小和消失，以及羊水过多。
产前胎儿食道闭锁可较难确诊，胎儿食道闭锁大多可能会出现羊水过多，还有泡沫的情况。
胎儿诞生后，可出现显著特点，例如唾液分泌过多、喝奶的时候会呛咳、无法插入胃管等。所以说，一旦胎儿有了食管闭锁现象就要及时进行诊治，这样才能避免发生并发症，保证母子健康安全。提示当检测到胎儿存在食道闭锁现象时，应给予积极的处理，以免贻误治疗最佳时期，提示孕妇怀孕期间应主动去医院进行产检，按期观察胎儿发育情况，注意怀孕期间应尽量避开放射线和其他辐射源，以免造成胎儿发生畸形的几率增加。
如果宝宝晨起干呕的现象是最近一段时间才出现，但是身体其他部位没有发现什么异常，或者只出现食欲不振，精神状态不太好，或者大便不正常的话，可能是胃肠道功能不好，消化不良，脾胃不和的表现，可以先给孩子吃几天，助消化调理脾胃的药物，也可以找专门的小儿推拿，给宝宝推拿按摩几天，如果效果不好或者全家人都不放心，可以带孩子去专门的小儿科做一下全面检查。
两岁宝宝干呕可能是呼吸道炎症、喝水较少、消化不良等原因导致的。
1.呼吸道炎症：宝宝呼吸道部有炎症，或者是喉咙里不舒服，患有咽炎、扁桃体炎等疾病，可能到导致两岁宝宝干呕。
2.喝水较少：两岁宝宝不喝水或者水喝得过少，缺水造成喉咙干，也会出现干呕的症状。
3.消化不良：如果宝宝进食过多，胃肠还没有消化完全，，也会出现干呕的症状。
如果症状不缓解或者干呕时间很长，最好到医院去就诊，对症治疗。
