孕妇患有乙肝小三阳可以通过以下方式进行处理：
如果是乙肝小三阳，也不用担心，要到感染科进行检查，做乙肝DNA、肝功能、腹部彩超等相关的检查，以确定肝功能是否正常。如果病情比较眼红，需要进行药物的抗菌治疗，也可以通过口服替诺福韦进行药物的抗菌治疗。新生儿在12个月之内要进行规范的阻断，同时要在12个小时之内进行乙肝疫苗和乙肝有效免疫球蛋白。
如果是乙肝小三阳，很多是不需要治疗的，需要检查一下肝功能和腹部彩超或者腹部CT。如果肝功能正常，腹部彩超或腹部CT没有慢性肝病或者肝硬化的表现，可以定期复查肝功、腹部彩超，一般不需要特殊治疗，但是要注意不要过于劳累，不要喝酒。如果有肝功转氨酶升高，腹部彩超、CT提示有慢性肝病或者肝硬化的表现，可以使用保肝药物。
如果是肝纤维化的小三阳，建议去三甲医院就诊，进行积极地检查。
一般情况下，乙型肝炎的小三阳纤维化很可能会发展成肝硬化，孕妇平时要注意饮食方面的调整，多吃含锌、镁的食品，少吃油腻、油炸、腌制的食品，避免吃油腻、油炸、腌制的食品，如果情况很严重的话，可以吃一些保肝的药，这样才能有效缓解症状，可以再怀孕。
得了乙肝小三阳需注意休息，进行定期的随访检查。
如果肝功能正常，肝脏形态结构正常，则不需要治疗。如果肝脏功能反复异常、病毒阳性，需进行抗病毒治疗。系统规范的抗病毒治疗可以将病毒抑制在检测不到的水平，身体的免疫、肝脏功能就不会遭受到明显破坏，已经损伤的肝脏功能也可逐渐修复。如果是乙肝小三阳，肝功能正常，肝脏的形态结构正常，病毒量比较低，则属于非活动性的乙肝病毒携带，暂时不需要治疗，保持良好作息，定期复查，避免熬夜劳累，避免喝酒即可，逐渐清除乙肝病毒。
乙肝小三阳肝功能异常，表明体内乙肝病毒对肝细胞已构成损伤，或受周围环境的影响而诱发，可以通过药物治疗、日常护理等方式进行处理。
患者需要及时就医，并且根据自身情况进行合理用药，同时还应该做好心理上的护理工作。建议病人在发现自己的疾病后，马上去正规的医院进行检查和治疗，以免耽误病情，因而错失了治疗的最佳时机。如果没有及时得到诊断的话，可以继续服用保肝药物进行治疗，同时也可以配合使用抗病毒药物进行治疗。治疗过程中必须遵医嘱，切勿自行随意停药，以免影响疗效。同时要定期复查一下肝病指标，及时进行调整。
此外，平时要注意休息和进食，可以增强身体抵抗力。