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脑炎后遗症的症状轻重不一，主要表现为精神方面异常。有不同程度的肢体运动障碍、智力障碍、失语、眼球麻痹、吞咽困难等后遗症。随着病情的恶化，会导致压迫神经，出现了脑活动不正常的现象。
可以采用药物治疗在相结合康复训练，要控制颅内高压、高热和抽搐发作尤为重要，精心护理可防止继发感染，注意饮食，生活要规律，也可去正规医院诊断后在配合医生治疗。
没有特效治疗方法，主要是对症治疗、支持治疗和防治并发症、如头痛严重者可用止痛药，脑水肿可适当应用甘露醇。抗病毒治疗可明显缩短病程和缓解症状，针对单纯性疱疹病毒及EB病毒多用药物治疗。如果脑炎严重的，可以造成运动，感觉功能障碍，有以上表现的，需要按医嘱口服调理神经功能的药物对改善以上症状有很好的作用。
脑炎后遗症是神经内科常见的疾病，是由于受到细菌病毒、寄生虫、霉菌等病原体的感染引起脑实质广泛性炎症，是一种急性疾病。病发时会产生高温高热、恶心呕吐、偏头痛，甚至是昏迷。
不手术也是可以治疗脑炎后遗症的，由于脑部是人的神经中枢系统，脑炎的发生引起全身复杂多样的症状，所以治疗脑炎采用的主要方法为对症治疗和抗病毒治疗两大方面。
中医的治疗就是理疗、针灸、推拿按摩等，或是通过长期的口服中成药物，进行清热解毒。脑炎后遗症注重护理，病程中应该加强对患者身体的护理，要供给一定的水分、营养及电解质。