通常情况下，先天性甲状腺功能减退可以通过使用药物、日常护理等方式进行治疗。具体情况分析如下：
使用药物：先天性甲状腺功能减退患者可能会出现易疲劳、怕冷、少汗等症状，患者可以按照医嘱服用左甲状腺素钠片、甲状腺片、维生素B12片等药物进行治疗。
日常护理：日常生活中，先天性甲状腺功能寒战应按医嘱用药，定期复查以监测病情，戒烟戒酒，饮食上以少盐的清淡食物为主，以促进身体的恢复。
先天性甲状腺功能减退症，是小孩逐渐表现出明显临床症状的先天性疾病，可能是甲状腺自身疾病引起的，也可能是其余部位病变引起甲状腺功能减退症的继发改变。
典型的临床症状主要是儿童看起来难看，例如头大、脖子短、皮肤粗糙、脸色泛黄、脸红肿、眼距宽、鼻梁低而平等等。儿童一般表现为精神较差，不活动，对周围事物不太感兴趣，怕冷，呼吸心率通常比较快，生长发育相对落后。这类疾病需要早期发现、早期治疗，才能使儿童恢复正常。
甲状腺功能减退的治疗可分为两种，具体如下：
1.亚临床甲减不用吃药。这种情况下的甲状腺功能减退，促甲状腺激素(TSH)一般在5-10之间，多根据临床症状决定是否用药。如果TSH在5-10之间，患者没有任何临床症状，暂时不用吃药。如果合并乏力、嗜睡等临床症状，超声出现巨大结节，建议使用甲状腺激素片，少量终身替代治疗，可缓解乏力症状，抑制甲状腺结节增多。
2.酪氨酸TSH大于10时，理论上需用酪氨酸片替代治疗一辈子。甲状腺激素片应根据年龄、心脏状况及活动量，由少量逐渐加量监测甲状腺功能。
先天性甲状腺功能减退症的病因通常是甲状腺不发育、甲状腺激素合成紊乱、促甲状腺激素不足等。
1、甲状腺不发育：如果甲状腺存在发育不全或移位的情况，可能导致先天性的甲状腺功能低下，其中1/3是甲状腺完全缺如，剩余部分则是由于发育不全或在移位时在异常位置滞留，或者完全失去了功能。
2、甲状腺激素合成紊乱：在甲状腺激素的合成和分泌中，由于体内的酶存在缺陷，可能导致甲状腺素缺乏，进而诱发先天性甲状腺功能减退症。
3、促甲状腺激素不足：由于垂体分泌促甲状腺激素紊乱，可能导致促甲状腺激素不足，引起先天性甲状腺功能减退症，考虑与特发性垂体功能低下、下丘脑垂体发育不良有关。
先天性甲状腺机能低下是指由于新生儿的遗传变异引起的，引起的甲状腺激素下降。先天甲亢的症状是儿童的生长和智商下降，大部分儿童在一开始的时候体长基本在正常的水平，到了出生后，其身高的增长和身体的重量都会下降。
此外，由于甲状腺激素在神经系统的发展中扮演着非常关键的角色，所以如果甲状腺激素不足，则会对智商造成一定的损害。还有一些先天的甲状腺功能低下，会出现一些其它的异常，比如心脏的异常，比如泌尿系统的异常。
中医认为，阳虚是导致甲减的原因，因为阳虚则生内寒，不能温暖脾土，采用中医可以很好的改善甲状腺的功能，达到治愈。甲状腺功能减退症状可见怕冷、少言乏力，表情淡漠、唇厚舌大，皮肤干燥发凉，眉毛稀疏。
