巧克力囊肿，如果症状不太明显，不影响正常生活，可以不用治疗，注意观察。巧克力囊肿如果症状比较明显，影响了正常生活，那么可以采取手术治疗的。但是巧克力囊肿治疗以后容易复发的，所以每年也要注意复查。
需要治疗。巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢引起的．子宫肌瘤可能和内分泌有关．治疗有保守和手术两种方法，保守疗法一般是考虑中医中药的方法的。巧克力囊肿是“肿块”但并非“肿瘤”，是子宫内膜异位症的一种病变。建议经药物治疗效果不明显，或卵巢有较大包块的，可以采用保守性手术。
本来是应该只存在于子宫内，子宫内膜具有根据体内激素水平的变化周期性增殖、脱落而形成月经。子宫内膜出现在别的地方。出现在其他地方的子宫内膜也和处于子宫内的子宫内膜一样，具有周期性增殖、脱落的规律。
B超发现卵巢囊肿，明确告知囊肿是良性还是恶性，是否诊断卵巢巧克力囊肿，这是不现实的。b超可判定盆腔是否有囊肿，囊肿位置及囊肿内部结构，但不能诊断子宫内膜异位症。子宫内膜异位症有时很难与卵巢恶性肿瘤、结核病和炎性肿块区分开来。
巧克力囊肿术后饮食，没有什么明显的饮食禁忌，对于新鲜的水果、蔬菜、鱼、虾、瘦肉、鸡蛋、牛奶均可以食用。但是对于比较特殊的食物，比如豆制品、豆浆、蜂王浆，尽量减少食用或者是不食用。
