分期为极低危险度或低危险度的胃肠道间质瘤患者，术后复发或转移的风险较低，一般不需要进行术后的。辅助化疗。部分为中危险度或高危险度的患者，需接受术后的辅助化疗，应口服药物2—3年。坚持术后随访，定期复查。
胃肠道间质瘤术后是需要吃药的，因为术后也是会有一定转移的复发几率，为了把转移和复发率降到最低，所以术后需要用药，中度风险的患者吃药的时间在一年左右，如果是高度复发风险的病人可以吃三年以上。
胃肠道间质瘤需要手术治疗，要求R0切除，术后还要进行辅助化疗、一系列的治疗，胃肠道间质瘤术后有复发率，常规胃肠道间质瘤的复发率很高，一般在40%-90%，原发病灶比较孤立或者小的病灶，复发率是35%。
手术后采用中医动态的疗法服用中草药全面调养综合治疗，防止复发和转移，有效的控制病情，达到彻底康复的目的。只是西医方面确实没有什么更好的方法，只能是手术、放疗、化疗，切了再切，直到生命结束，病人一直在痛苦中度过。
如果是胃肠道间质瘤的情况，那么考虑这个时候出现有骨转移的话。胃肠道间质瘤的治疗。具体的是手术联合靶向分子药物的综合治疗方法那么这个时候出现转移，考虑是需要结合病理的情况。遵医嘱进行进一步的治疗改善的。
胃间质瘤即是一种发生于消化道的少见的肿瘤，它属于间叶肿瘤的一种。只要身体条件允许，没有转移，应首选手术，手术后完全可以康复的。以后重在预防复发，不使用致癌物质，像腌制的东西油炸的尤其，像花生，腐烂的水果等，多吃新鲜的果蔬。