月经不调右侧卵巢囊肿可以通过药物治疗、手术治疗等方法进行治疗。
如果右卵巢囊肿比较少，不需要做外科手术，可以在医生的指导下服用短期的避孕药。炎症性囊肿可以通过服用一些活血化瘀的中药来进行调理。一般在卵巢囊肿治愈后，女性经期不规律是可以自行恢复的。
当卵巢囊肿的大小超过5cm，或囊肿的增长速度快时，需要住院进行外科切除病变，主要是通过腹腔镜进行手术。
患有卵巢囊肿也可能导致月经不调，因为月经是由雌激素和孕酮的相互作用和相互调节来维持的。雌激素和黄体酮主要由卵巢分泌，所以当卵巢有囊肿，特别是相对较大的囊肿时，可能会影响激素分泌，从而导致月经不调。
卵巢囊肿是生理性的囊肿，一般都是生理性的，一般都是生理性的，不会对胎儿的发育造成任何的影响，一般不需要特别的处理，定期复查，如果囊肿的直径超过5cm，可以在妊娠的中期进行手术。平时要多喝热水，多吃一些新鲜的蔬菜和水果，避免食用辛辣刺激性的食物，做好孕期的各项检查，保证充足的睡眠，并且保持良好的情绪。
怀孕卵巢囊肿一般需观察孕十二周，因妊娠后亦可并发黄体囊肿。卵巢囊性肿瘤是一种罕见疾病。黄体囊肿可随妊娠持续而自行变小，甚至消失。若是有恶变的可能时必须立即就医检查。最近若发生良性囊肿伴出血，不是扭转破裂，也不是疑似恶性的。若是子宫内膜异位而引起不孕时必须立即就诊。无论妊娠哪期，均应积极手术，以免耽误病情。卵巢是孕育胎儿最重要的场所之一，而子宫则对卵子起着保护作用。妊娠12周以前，卵巢囊肿手术不容易，由于妊娠12周前胎盘尚未形成，无法产生充足孕激素，无法维持胚胎发育。此时子宫内膜已开始增生并有成熟细胞分泌出大量孕酮，这时若对胎儿已经发生影响，就应及时终止妊娠。
建议孕妇保持良好的心态，主要休息，主要合理饮食。
卵巢囊肿破裂以后处理方法如下：
对于小的囊肿或单纯浆液性囊腺瘤破裂症状，患者此时可以随诊观察，一般无需特殊治疗，也可以适当应用抗生素预防感染；而对于大囊肿或畸胎瘤破裂的症状，患者常有剧烈腹痛，伴有恶心、呕吐，血压下降等症状，建议患者及时住院，完善相关化验，通过给予补液、抗休克、积极准备手术治疗等方式进行治疗，手术中尽量吸净囊液，并涂片行细胞学检查，明确诊断。