一般情况下，新生儿肠炎是由于小儿的肠道粘膜屏障功能差，在进食时，不洁食物进入就会感染肠道的炎症。
一般母乳喂养的孩子，增强肠道免疫力的抗体，在母亲乳汁含有，所以患肠炎的概率比较小一些。但如果卫生没有注意，或者奶瓶没有清洁、消毒，冲调奶粉时间过长，也是有可患肠炎的可能性。建议去医院进行大便常规检查，已确定是否是肠炎，当患了肠炎，建议使用敏感的抗生素治疗，在恢复身体健康后，及时补充肠道微生态制剂。
新生儿肠炎是由多种病原体引起的，如细菌、病毒、真菌等。其中常见的有细菌和病毒。所以需要确定什么是病原体感染。
在治疗中，如果腹泻呕吐严重，可以短时间禁食8小时，然后开始喂养。母乳或稀释牛奶或腹泻奶粉为佳。补充液体，防止脱水，纠正脱水，这要看宝宝腹泻的程度。
抗生素用于感染，微生态调节剂益生菌用于补充肠道正常菌群。所以肠炎的治疗要看宝宝的情况。
新生儿肠炎会出现恶心呕吐，食欲减退，腹胀，腹泻，腹痛等一系列的症状，可以在医生指导下予抗生素以及抗病毒的药物治疗，同时需要给予营养支持，并且要维持水电解质平衡，避免出现水电解质平衡紊乱以及休克的症状。
以胃肠道症状为主，食欲不振，偶有溢乳或呕吐，大便次数增多（3～10次/日），无脱水及全身中毒症状，多于数日内痊愈，大便常规可见少量白细胞。急性起病，或由轻度腹泻转变而来。常有较为严重的胃肠道症状，尚可伴有较为明显的脱水、电解质紊乱及全身中毒症状，严重者可死亡。吐、泻亦可导致代谢性酸中毒，表现为精神萎靡，呼吸深长，严重者可昏迷。严重腹泻及进食不足亦可导致低钾血症及低钙血症。
主要症状有胃肠道症状：表现为大便次数增多到每天10多次，常考虑有腹泻，正常大便母乳喂养5-6次以内、奶粉喂养一日3次以内；大便性状的改变：出现水样便、黏液或者血便的情况。
首先会表现为大便的异常。孩子有肠炎以后，最先表现为大便次数的增多、大便的性状变稀，这属于肠炎最为常见的症状。其次孩子会出现消化道的不适症状，比如孩子会出现肚子胀、腹痛、阵发性的哭闹等，这都属于消化道的症状。
