常有发作期与缓解期交替或持续性逐渐加重，偶呈急性暴发。直肠炎症状反复发作的原因有，轻信偏方、盲目治疗，许多人由于各种各样原因，不去正规肛肠医院进行治疗。轻信偏方，盲目服用药物，其结果只能是越治越重，治疗浅尝辄止，部分人虽然接受了正规治疗，但是却不能坚持下来，病情稍一缓解就擅自停止用药，结果造成病情反复发作，以至于越来越重，还导致疾病对药物的敏感性下降，耐药性增强，治疗难度加大。
直肠炎反复患者可以口服氧氟沙星、甲硝唑、奥硝唑等药物治疗。
直肠炎患者除了要积极配合医生治疗以外，平时要养成良好的饮食习惯，注意饮食卫生，戒烟戒酒，避免浓茶浓咖啡，不能吃辛辣刺激性食物，注意腹部保暖。治疗期间患者要注意多休息，同时坚持清淡饮食，不要吃辛辣刺激性食物，比如火锅、冰可乐等，有利于身体恢复。
从直肠炎的发病症状可以将直肠炎分为慢性直肠炎和畸形直肠炎两种。患直肠炎主要是体质虚弱，免疫低下的人群。对慢性直肠炎病人要适当的休息，进食要清淡、少渣、营养丰富、无刺激性，并做到心情愉快，劳逸结合。慢性直肠炎急性发作时，予以清热解毒、润肠通便；里急后重，便次多者需要清理荡积，直肠粘膜水肿者，可以灌洗直肠，对于粘膜糜烂者、括约肌、肛提肌痉挛者、直肠粘膜萎缩变干者等，要根据不同的症状给予不同的治疗。
一般直肠炎伴有浅表糜烂多为溃疡性直肠炎的症状，通常表现为，粘液脓血，便次增多，肛门下坠，腹痛，有时可能滴鲜血。可以使用中药灌肠治疗，配合外用药物治疗，要多吃蔬菜和水果，多喝水。
轻症腹胀、消瘦、乏力、肠鸣、失眠、多梦、怕冷，严重者有可发热，心跳加速，以及衰弱，贫血，失水，电解质平衡推敲和营养障碍。重者鲜血下流，以至休克、癌变。急性期的症状迁延不愈或直至放疗结束6个月至数年后始有显著症状者，均提示病变延续，终将发展引起纤维化或狭窄。此期内的症状，早的可在放疗后半年，晚的可在10年后甚至30年后才发生，多与肠壁血管炎以及扣续病变有关。