如果是在妊娠早期，多为胚胎本身质量的不好，或者受精卵结合是偶尔的染色体变异，或者自然的优胜劣汰。如果是在顺利着床，正常发育的过程中，是胚胎发育的问题，或者是受到外界影响的可能。
如果是由于弱精症，会对精子的品质造成一定的不良影响，与胚胎停育之间有关系。
如果精子的品质不佳，会与卵子的结合后，容易造成受精卵的品质下降，会造成胎儿的发育不良。如果胎儿发生了胚胎停育，建议及时进行清宫手术，以避免流产。平时可以多食用鱼类、奶制品等富含蛋白质和精氨酸的食品，以改善精子的品质，必要时应该就医检查。
胚胎停育应该及时的去医院做相关的检查，明确病因对症治疗。因为是有生殖内分泌原因，是黄体功能不全，多囊卵巢原因有关系的，也会有男性的精子质量。还有子宫和卵巢功能问题，子宫大小是否有异常，异常的细菌性感染或者衣原体问题。
因为停止发育的胚胎稽留在体内，会和子宫之间形成粘连，带来凝血异常、感染等问题，仅靠药物流产是流不干净的，所以一旦确诊胎停后，必须要及时进行清宫手术。术后两周内要尽量充分休息，不要从事重体力劳动和使用冷水，避免身体受寒。还要注意平时增加营养，增强机体对疾病的抵抗力，促进受损器官的早日康复。
胚胎停育的前兆主要有阴道出血、腹痛、妊娠反应逐渐停止、基础体温下降，如果处于孕中晚期，症状主要有胎动逐渐减少，没有胎动。孕期内分泌有问题也会直接影响到胚胎发育，因为受精卵着床发育成为胚胎，然后再发育成为胎儿，都需要黄体功能来维持，内分泌有问题，黄体酮分泌也会异常。