婴儿十二指肠狭窄手术可以通过小切口或开腹，在全麻的条件下，将狭窄的肠段切掉，然后缝合。
小儿十二指肠狭窄是一种先天性的肠道畸形，可以通过肛门将支架插入到狭窄的位置进行扩张。严重的儿童不仅造成肠梗阻，而且会影响肠道血液循环，对新生儿的生命造成威胁。手术后在宝宝应停止进食一段时间，并给予肠外营养，直到排气排便。
怀孕28周，四维彩超检查胎儿有十二指肠的狭窄，通常有十二指肠狭窄的孩子，还会伴有其他器官结构系统的畸形，所以还要进一步地做，四维彩超的复查，如果狭窄的程度不是很严重，那么可以在产后及时做手术。否则，可能会影响胎儿出生以后的生存率。
未出生的胎儿十二指肠狭窄，在肚子里是没有事情的，不会影响出生情况和孕妇的身体，但是出生后一定要立刻联系相关机构，进行手术或者矫正，如果不矫正的话，孩子不会活太长时间，是有生命危险的。
新生儿的消化道畸形主要是先天性肠狭窄和先天性肠闭锁，这种情况一般都是通过外科手术来治疗的。
外科治疗的原则就是要清除狭窄，按照狭窄的类型，可以分为肠腔狭窄和膜状狭窄，有些是因为肠外肿瘤压迫造成的。如有肝外压迫，应先排除压迫。如果有肠管狭窄，需要先切除肠管，再进行肠腔吻合。
建议在治疗期间多给新生儿补充营养，尽量母乳喂养。
肛门直肠狭窄的儿童，如果影响正常功能，可以按照医生的建议采取一些肛门扩张手术。平时，应该给孩子的腹部做顺时针方向的按摩，并适当饮用一些温水。母乳喂养的孩子的母亲也应该注意他们的饮食。他们应该多吃芹菜菠菜、黄瓜、苦瓜、鳄梨和火龙果，主要是含有更多粗纤维的食物。
如果是轻度的肛门直肠狭窄，就有可能会导致大便变细或者是呈扁状，主要就是由于粪便在直肠内停留过久发酵，这样就有可能会导致肛门狭窄。如果是属于中度的肛门狭窄，会出现排便困难，或者是排出少量稀的大便，也有可能会出现大便次数增多，或者是伴有脓血样以及粘液样的大便。